RNA–Protein interactions for RNA: YKR011C

YKR011C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR011C, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR011C	YKR011C	VPS36	Q06696	566 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR011C	YKR011C	USV1	Q12132	391 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR011C	YKR011C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YKU70	P32807	602 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	BDH2	P39713	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	SWI6	P09959	803 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	SET3	P36124	751 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YIL077C	P40508	320 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	BIT61	P47041	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YGR153W	P48238	217 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	UME1	Q03010	460 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	VPS72	Q03388	795 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	ABF1	P14164	731 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	KIN82	P25341	720 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YIL166C	P40445	542 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	MPS3	P47069	682 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	GPG1	P53130	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YGR151C	P53287	111 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YPS7	Q06325	596 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	IME1	P21190	360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	SEC15	P22224	910 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	TOM20	P35180	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	CTP1	P38152	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	COS111	P38308	924 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	HXT7	P39004	570 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RFX1	P48743	811 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	ECM9	Q02202	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YFT2	Q06676	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	NUP145	P49687	1317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	FUB1	P25659	250 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	SEC65	P29478	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	EMP70	P32802	667 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	GMH1	P36125	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	KHA1	P40309	873 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	BUD8	P41698	603 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	PXA1	P41909	870 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YGR237C	P50089	785 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	HFD1	Q04458	532 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	NTH1	P32356	751 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	PPZ2	P33329	710 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	OAF3	P36023	863 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	DID4	P36108	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	STP4	Q07351	490 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	HFI1	Q12060	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	APM4	Q99186	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YEL020C	P39994	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	IES1	P43579	692 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YHM2	Q04013	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	PPN1	Q04119	674 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR011C	YKR011C	RPN13	O13563	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	SPO11	P23179	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	KCC4	P25389	1037 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	ADY2	P25613	283 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	DUN1	P39009	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	BNR1	P40450	1375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	SNM1	P40993	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	YGL081W	P53156	320 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	NMA2	P53204	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	SPO1	P53541	631 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	ARO10	Q06408	635 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	RKI1	Q12189	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	TSR4	P25040	408 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	APL3	P38065	1025 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	FAT1	P38225	669 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR011C	YKR011C	TAF4	P50105	388 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.9 ms