RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	ADY2	P25613	283 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	EMP70	P32802	667 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	SET3	P36124	751 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	CKB2	P38930	258 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	YEL020C	P39994	560 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	MPS3	P47069	682 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	ARO10	Q06408	635 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	AIM44	Q99299	758 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	KIN82	P25341	720 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	NTH1	P32356	751 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	PET127	P32606	800 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	COS111	P38308	924 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	RFX1	P48743	811 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	NMA2	P53204	395 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	YLR407W	Q06070	228 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SFT1	YKL006C-A	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	APL3	P38065	1025 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	BEM4	P39011	633 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	RET2	P43621	546 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	BIT61	P47041	543 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YJR096W	P47137	282 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YFT2	Q06676	274 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	THI73	Q07904	523 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
SFT1	YKL006C-A	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YKU70	P32807	602 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	CTP1	P38152	299 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	KHA1	P40309	873 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	SEC6	P32844	805 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	FLO10	P36170	1169 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	PXA1	P41909	870 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YGR153W	P48238	217 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	IMO32	P53219	342 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	DIP5	P53388	608 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	LAM4	P38800	1345 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	STE12	P13574	688 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	DUN1	P39009	513 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	MUP3	P38734	546 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	PMT3	P47190	753 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	COQ11	Q05892	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YPS7	Q06325	596 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	SEC65	P29478	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YPT7	P32939	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	ELF1	P36053	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	PAC2	P39937	518 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	PPN1	Q04119	674 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	THI7	Q05998	598 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	NUP145	P49687	1317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SFT1	YKL006C-A	YMC2	P38087	329 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	BUD8	P41698	603 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PMT6	P42934	759 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	UME1	Q03010	460 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YHM2	Q04013	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	UFO1	Q04511	668 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	RKI1	Q12189	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	SWI6	P09959	803 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	TMN3	P40071	706 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YJR142W	P47173	342 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	ECM9	Q02202	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	FMP30	Q02883	468 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	HFD1	Q04458	532 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PHO5	P00635	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MDM10	P18409	493 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	VPS34	P22543	875 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	ORC2	P32833	620 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	THI6	P41835	540 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MRK1	P50873	501 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	STP4	Q07351	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	IZH3	Q07959	543 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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