RNA–Protein interactions for RNA: YGR239C

PEX21, Transcript of Peroxin required for peroxisomal matrix protein targeting, yeast

Gene PEX21, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX21	YGR239C	EXO84	P38261	753 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	PXA1	P41909	870 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	ECL1	P48235	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	TAF4	P50105	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	MRPS35	P53292	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	TMA10	Q06177	86 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	HOP1	P20050	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	CBP3	P21560	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	ERR3	P42222	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	IRC5	P43610	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	MDR1	P53258	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	PPN1	Q04119	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
PEX21	YGR239C	IME1	P21190	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	SEG2	P34250	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	CTF13	P35203	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	APM3	P38153	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	ACA1	P39970	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	GID8	P40208	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	BUD8	P41698	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	IML2	P47031	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	INP52	P50942	1183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	ARP7	Q12406	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX21	YGR239C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	TOD6	P34219	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	ECM1	P39715	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	VID27	P40157	782 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MAD3	P47074	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	HLR1	Q04429	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	NKP1	Q12493	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	ADH4	P10127	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	KIN82	P25341	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SSH4	P32343	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	TAF5	P38129	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PPE1	P38796	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	BIT61	P47041	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MNT2	P53059	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MTL1	P53214	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	GTR1	Q00582	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	NSE5	Q03718	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PSR2	Q07949	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	HOS1	Q12214	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	VPS5	Q92331	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SOD2	P00447	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MSM1	P22438	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SWD1	P39706	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	GET2	P40056	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	YML131W	Q03102	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	BLS1	Q06071	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	POM34	Q12445	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MET3	P08536	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	LST4	P34239	828 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PRM2	P40534	656 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	IMA5	P40884	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SPO1	P53541	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SSM4	P40318	1319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PHO5	P00635	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	HMG2	P12684	1045 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	PRE4	P30657	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	BEM3	P32873	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	YIL077C	P40508	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	TAF1	P46677	1066 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	UBA2	P52488	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	RIM8	P53179	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	YNR071C	P53757	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	DLT1	Q04216	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	ARG1	P22768	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	FMO1	P38866	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	LYS9	P38999	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	YIR042C	P40586	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MAD2	P40958	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	MUP1	P50276	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	TIM50	Q02776	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX21	YGR239C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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