RNA–Protein interactions for RNA: YGR058W

PEF1, Transcript of Penta-EF-hand protein, yeast

Gene PEF1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEF1	YGR058W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	GMH1	P36125	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YIL077C	P40508	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	MPS3	P47069	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	VHS3	Q08438	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	POM34	Q12445	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	MAL31	P38156	614 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	MUP3	P38734	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	BIT61	P47041	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	COQ11	Q05892	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	ABF1	P14164	731 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	PET127	P32606	800 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	CTP1	P38152	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	MNN1	P39106	762 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	MIT1	P40002	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	KCC4	P25389	1037 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YKU70	P32807	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YKR075C	P36155	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	COS111	P38308	924 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	KHA1	P40309	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	NMA2	P53204	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	SPC98	P53540	846 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YFT2	Q06676	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	STE12	P13574	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	SFP1	P32432	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	PAC2	P39937	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YJR096W	P47137	282 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	LAM4	P38800	1345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	PHO5	P00635	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	IME1	P21190	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	KIN82	P25341	720 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YMC2	P38087	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	TDA3	P38758	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	RET2	P43621	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	MRK1	P50873	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	DNM1	P54861	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	YPS7	Q06325	596 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	RKI1	Q12189	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	ADR1	P07248	1323 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	SEC15	P22224	910 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	SNF12	P53628	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	SWI6	P09959	803 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	NTH1	P32356	751 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	CKB2	P38930	258 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	PMT6	P42934	759 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	OSW1	Q08692	278 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEF1	YGR058W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	MDS3	P53094	1487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	VPS34	P22543	875 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ELF1	P36053	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	APL3	P38065	1025 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	BUD8	P41698	603 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	BFA1	P47113	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	DIP5	P53388	608 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	STP4	Q07351	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	IZH3	Q07959	543 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
PEF1	YGR058W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	SNM1	P40993	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	BUD4	P47136	1447 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	AFT2	Q08957	416 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	ORC2	P32833	620 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	YGR153W	P48238	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	UFO1	Q04511	668 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	YMC1	P32331	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	PXA1	P41909	870 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	HLJ1	P48353	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	FMP30	Q02883	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PEF1	YGR058W	THI73	Q07904	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.2 ms