RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	GIN4	Q12263	1142 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	PET123	P17558	318 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	MSH1	P25846	959 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	DPB3	P27344	201 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CDC15	P27636	974 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	DEP1	P31385	405 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YEL043W	P32618	956 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SAP190	P36123	1033 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	PCH2	P38126	564 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NPR2	P39923	615 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NIT3	P49954	291 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	MRS2	Q01926	470 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	GAS5	Q08193	484 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YLL058W	Q12198	575 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YDR215C	Q12240	137 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SPC29	P33419	253 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	AKR1	P39010	764 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CAJ1	P39101	391 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	IRC8	P47046	822 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RNT1	Q02555	471 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	UME1	Q03010	460 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	VPS38	Q05919	439 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CYB2	P00175	591 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CDC6	P09119	513 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CLB1	P24868	471 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	ERT1	P38140	529 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YHL012W	P38709	493 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	PIK1	P39104	1066 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NDC80	P40460	691 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	DAM1	P53267	343 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SML1	Q04964	104 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RSB1	Q08417	382 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	TOP1	P04786	769 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CDC9	P04819	755 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SNF5	P18480	905 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	COQ1	P18900	473 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NPP1	P25353	742 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	AFR1	P33304	620 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	EFM2	P38347	419 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YER158C	P40095	573 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	MMM1	P41800	426 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YFL054C	P43549	646 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BUD9	P53226	547 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RBA50	Q04418	439 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YLR001C	Q07895	862 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	TLG2	Q08144	397 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	MDM38	Q08179	573 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	NYV1	Q12255	253 aa		6.16	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	AI3	P03877	415 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BI4	P03879	638 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SRD1	P09007	221 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RAD18	P10862	487 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YEL1	P34225	687 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	EMC3	P36039	253 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YKL151C	P36059	337 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YKR075C	P36155	307 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BAP2	P38084	609 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BCD1	P38772	366 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	VPS41	P38959	992 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	BUD16	P39988	312 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	GYP8	P43570	497 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	ATG36	P46983	293 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	FOL1	P53848	824 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	EAR1	Q03212	550 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YDR514C	Q04408	483 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	YPR196W	Q06595	470 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PSH1	YOL054W	RPO26	P20435	155 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SPO11	P23179	398 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	MAL31	P38156	614 aa		6.14	□□□□□ -1.43
PSH1	YOL054W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43

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