RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TCB2	P48231	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HLR1	Q04429	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	HIM1	Q06674	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	GLE1	Q12315	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ARP7	Q12406	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	ISA2	Q12425	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.64	not detected
STB2	YMR053C	CLC1	P17891	233 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CLN1	P20437	546 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GYP6	P32806	458 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RER2	P35196	286 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SIF2	P38262	535 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	STU2	P46675	888 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MDR1	P53258	950 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TEP1	P53916	434 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MET17	P06106	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MTF2	P10849	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HOP1	P20050	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SLC1	P33333	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	IXR1	P33417	597 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	OSW5	P40219	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LCB2	P40970	561 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SMK1	P41808	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YNL050C	P53952	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TOF2	Q02208	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ADA2	Q02336	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	NSI1	Q12457	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PUT4	P15380	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MRP4	P32902	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LOT5	P34234	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DID4	P36108	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RGA1	P39083	1007 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SNF12	P53628	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TOF1	P53840	1238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ECM9	Q02202	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SKY1	Q03656	742 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MDY2	Q12285	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HMG1	P12683	1054 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GIM3	P53900	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ARP5	P53946	755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MGR3	Q04472	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	GUD1	Q07729	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RTN2	Q12443	393 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SGF29	P25554	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SUR1	P33300	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RIM11	P38615	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RRM3	P38766	723 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PIH1	P38768	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MTG2	P38860	518 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HDA2	Q06629	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PSY3	Q12318	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YLR358C	O13565	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SWI5	P08153	709 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	DMC1	P25453	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ADK2	P26364	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	MGM1	P32266	881 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	ECM4	P36156	370 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YER010C	P40011	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RPA14	P50106	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LCD1	Q04377	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RSF1	Q05043	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TRM8	Q12009	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	BUG1	Q12191	341 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	TAF3	Q12297	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	SPS22	P25380	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YCL049C	P25577	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	YUH1	P35127	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	HSL7	P38274	827 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	PAN5	P38787	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STB2	YMR053C	LAM1	P38851	1228 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 83.5 ms