RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	FAA3	P39002	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	HEH2	Q03281	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	NSE5	Q03718	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SPH1	Q06160	661 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	GIC2	Q06648	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SPO21	Q12411	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	LAM4	P38800	1345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RPB10	P22139	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	IRR1	P40541	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	KEL2	P50090	882 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	GPG1	P53130	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	VPS30	Q02948	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	DAL4	Q04895	635 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	BSC2	Q05611	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RSC2	Q06488	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	FMP25	Q08023	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RKM4	Q12504	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	GSY1	P23337	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RER1	P25560	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PPZ1	P26570	692 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	ISC10	P32645	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	TEL1	P38110	2787 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	KTR4	P38131	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RKM3	P38222	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	DSS1	P39112	969 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	JEM1	P40358	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	IRC8	P47046	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	BNA1	P47096	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	CTR1	P49573	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	MSC2	Q03455	724 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SCM3	Q12334	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	IRA2	P19158	3079 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SNA3	P14359	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RGP1	P16664	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	AEP2	P22136	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RAD51	P25454	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SUV3	P32580	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	BCD1	P38772	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YTA12	P40341	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YIL166C	P40445	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RET2	P43621	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SPO74	P45819	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	MET13	P53128	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RSC4	Q02206	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PNG1	Q02890	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	LCD1	Q04377	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RSC58	Q07979	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SDH5	Q08230	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PGC1	Q08959	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	APC11	Q12157	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RFU1	YLR073C	RED1	P14291	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	FUN30	P31380	1131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	DBF4	P32325	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	IME2	P32581	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SMC1	P32908	1225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	DUT1	P33317	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YHL041W	P38730	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RTS1	P38903	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	HIS6	P40545	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	FIG4	P42837	879 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RTA1	P53047	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YGL242C	P53066	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SHE9	Q04172	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SUE1	Q06524	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	GUD1	Q07729	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RFU1	YLR073C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RAD61	Q99359	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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