RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	EFM2	P38347	419 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	IES1	P43579	692 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	DAL2	P25335	343 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	BCH2	P36122	765 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	YKR051W	P36142	418 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	FAP1	P53971	965 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	SAM3	Q08986	587 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	RAD16	P31244	790 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	XRS2	P33301	854 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	RAD55	P38953	406 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	YTA12	P40341	825 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	GCN5	Q03330	439 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	NIP100	P33420	868 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	CSG2	P35206	410 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	GUF1	P46943	645 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	ZAP1	P47043	880 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	SFB2	P53953	876 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	YHM2	Q04013	314 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	TMA16	Q08687	178 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	YPQ1	Q12010	308 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	NBP2	Q12163	236 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	NDJ1	Q12366	352 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	HIS5	P07172	385 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	PSY4	P38193	441 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	HXT5	P38695	592 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	DDC1	Q08949	612 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	SIR1	P21691	654 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	SCJ1	P25303	377 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	SAP190	P36123	1033 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	MED6	P38782	295 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	AVT2	P39981	480 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	VTC4	P47075	721 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	MND1	P53102	219 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
PUF3	YLL013C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	FUS1	P11710	512 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ATE1	P16639	503 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	STE11	P23561	717 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	MSH3	P25336	1018 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	DAL1	P32375	460 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ARP1	P38696	384 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	DYS1	P38791	387 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	NUP60	P39705	539 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	PFD1	P46988	109 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	NSE1	Q07913	336 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	TRE1	Q08919	783 aa		6.09	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	JIP3	O13555	125 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	YER152C	P10356	443 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SMC1	P32908	1225 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	BSP1	Q06604	576 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	YPR078C	Q06813	372 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	PPH22	P23595	377 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SEG2	P34250	1132 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	YMC2	P38087	329 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	YBR225W	P38321	900 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	CDC1	P40986	491 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ESBP6	P53918	673 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SDS3	P40505	327 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	GYP8	P43570	497 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	VPS70	P47161	811 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	TUB4	P53378	473 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ARO80	Q04052	950 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	TMN2	Q04562	672 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	MDM38	Q08179	573 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SEC65	P29478	273 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	ISF1	P32488	338 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	DSS4	P32601	143 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	FHL1	P39521	936 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	HFM1	P51979	1187 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	SSL2	Q00578	843 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	VPS54	Q12071	889 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PUF3	YLL013C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44

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