RNA–Protein interactions for RNA: YJR005C-A

LSO1, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene LSO1, Length 282 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LSO1	YJR005C-A	YGR021W	P53212	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ESBP6	P53918	673 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	BOP3	P53958	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	VTC3	Q02725	835 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	TFB3	Q03290	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YMR018W	Q04364	514 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	DAS2	Q12084	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SLX4	Q12098	748 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YDR215C	Q12240	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ZRT2	Q12436	422 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CDC8	P00572	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	MOT1	P32333	1867 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	HXT1	P32465	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	COT1	P32798	439 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	NFU1	P32860	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CNS1	P33313	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	MRX3	P38172	270 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	VID24	P38263	362 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SPC72	P39723	622 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SPR3	P41901	512 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RPC17	P47076	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ACF4	P47129	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	KAP114	P53067	1004 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ROD1	Q02805	837 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	NGL3	Q03210	505 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SHS1	Q07657	551 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	MET7	Q08645	548 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
LSO1	YJR005C-A	TRM11	Q12463	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	MAS2	P11914	482 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	KIP1	P28742	1111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SWI3	P32591	825 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RGT1	P32862	1170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	GPT2	P36148	743 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	HIS2	P38635	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	FTR1	P40088	404 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ENV11	P53246	860 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	BTN2	P53286	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YNL146W	P53906	100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
LSO1	YJR005C-A	URH1	Q04179	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YMR321C	Q04898	105 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	COQ9	Q05779	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	IES4	Q08561	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	HFI1	Q12060	488 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	HIF1	Q12373	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RAD1	P06777	1100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RRN6	P32786	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	BLI1	P35727	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	EXO5	P38289	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RCK2	P38623	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YTA12	P40341	825 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	MIC19	P43594	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CPR7	P47103	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ORC5	P50874	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SHE10	P53075	577 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	RNT1	Q02555	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	TRS130	Q03660	1102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	OMS1	Q06668	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	NUR1	Q12066	484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	SWI5	P08153	709 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	HVG1	P0CE11	249 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	ERG11	P10614	530 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	YUR1	P26725	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LSO1	YJR005C-A	DBF4	P32325	704 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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