RNA–Protein interactions for RNA: YHR203C

RPS4B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS4B, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS4B	YHR203C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	FOB1	O13329	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SPE1	P08432	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CIT2	P08679	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PCK1	P10963	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RGP1	P16664	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	DIT1	P21623	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RPB10	P22139	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PEX1	P24004	1043 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PGS1	P25578	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YSC83	P32792	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	COY1	P34237	679 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PET10	P36139	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RIM4	P38741	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ERC1	P38767	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ERP5	P38819	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	LSB6	P42951	607 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	VTC2	P43585	828 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YGR153W	P48238	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	GUP1	P53154	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TOF1	P53840	1238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	EEB1	Q02891	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	NSE5	Q03718	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SGO1	Q08490	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	STB3	Q12427	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	COX4	P04037	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	RPC31	P17890	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PRR1	P28708	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PPS1	P38148	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YEL076C	P39971	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	QDR1	P40475	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	THI6	P41835	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	DAK2	P43550	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TAF10	Q12030	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PTC5	Q12511	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PHO8	P11491	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PDE1	P22434	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SGF29	P25554	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PEX34	P25584	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	PEX2	P32800	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MNN4	P36044	1178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	DYS1	P38791	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TAF1	P46677	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	VPS25	P47142	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	STB4	P50104	949 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ORC5	P50874	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SKP1	P52286	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TAM41	P53230	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ENV11	P53246	860 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RPS4B	YHR203C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ARK1	P53974	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ADA2	Q02336	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	NSE1	Q07913	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	LAA1	P39526	2014 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	GAL80	P04387	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	FUS1	P11710	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
RPS4B	YHR203C	YKL097C	P34245	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MAL33	P38157	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ARP1	P38696	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	FMO1	P38866	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CEM1	P39525	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	MDJ2	P42834	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	SPC98	P53540	846 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	STP1	Q00947	519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	COG8	Q04632	607 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	CTF3	Q12748	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS4B	YHR203C	HIS5	P07172	385 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	MSN1	P22148	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS4B	YHR203C	HCM1	P25364	564 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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