RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
NTF2YER009W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W HXT7P39004 570 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W BAP3P41815 604 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YJL163CP46996 555 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W COX18P53239 316 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W GIS1Q03833 894 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YLR407WQ06070 228 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W IRC13Q08630 104 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W TMA17Q12513 150 aa3.88□□□□□ -1.79
NTF2YER009W EUG1P32474 517 aa3.87□□□□□ -1.79
NTF2YER009W LYS9P38999 446 aa3.87□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YNL195CP40168 261 aa3.87□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YHM2Q04013 314 aa3.87□□□□□ -1.79
NTF2YER009W VHS3Q08438 674 aa3.87□□□□□ -1.79
NTF2YER009W HFI1Q12060 488 aa3.87□□□□□ -1.79
NTF2YER009W SWI6P09959 803 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W SEC65P29478 273 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YKU70P32807 602 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W OAF3P36023 863 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PAF1P38351 445 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W BCD1P38772 366 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W NUP60P39705 539 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W GET2P40056 285 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W UBC11P52492 156 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YMR210WQ03649 449 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W SGO1Q08490 590 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W APM4Q99186 491 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W ECM3Q99252 613 aa3.86□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PPS1P38148 807 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W FAT1P38225 669 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W CHS7P38843 316 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W FMO1P38866 432 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W FMP52P40008 231 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YJR120WP47157 116 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W VPS36Q06696 566 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W TRE2Q08693 809 aa3.85□□□□□ -1.79
NTF2YER009W FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PEX1P24004 1043 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W MRC1P25588 1096 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W DAL3P32459 195 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W HIR1P32479 840 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PET127P32606 800 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YBR071WP38243 211 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W FOL1P53848 824 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YMR206WQ03695 313 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W YPS7Q06325 596 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W PNS1Q12412 539 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W RMP1Q12530 201 aa3.84□□□□□ -1.79
NTF2YER009W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W AEP2P22136 580 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W YPT7P32939 208 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W REV7P38927 245 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W DAS1P47005 663 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W NIT2P47016 307 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W SLI1P53304 468 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W COG6P53959 839 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W CTF4Q01454 927 aa3.83□□□□□ -1.8
NTF2YER009W SIR3P06701 978 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W IME1P21190 360 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W TOM20P35180 183 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W SFB3P38810 929 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
NTF2YER009W DUN1P39009 513 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W VID28P40547 921 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W BIT61P47041 543 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W RIA1P53893 1110 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W MUK1Q02866 612 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W SKY1Q03656 742 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W THI22Q06490 572 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W STP4Q07351 490 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W POM34Q12445 299 aa3.82□□□□□ -1.8
NTF2YER009W SER1P33330 395 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
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