RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	IES4	Q08561	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SPE1	P08432	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CKA2	P19454	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RPB10	P22139	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	YKL097C	P34245	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NUP82	P40368	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	STU2	P46675	888 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	TCB2	P48231	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NUT1	P53114	1132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CUL3	P53202	744 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	PGA2	P53903	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	NSE5	Q03718	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	PLP2	Q12017	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	PTC5	Q12511	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REI1	YBR267W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PGS1	P25578	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	GCS1	P35197	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	HEL1	P36113	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PSY4	P38193	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MMS4	P38257	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YER186C	P40101	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YTA6	P40328	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	AAD14	P42884	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RSM26	P47141	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CBK1	P53894	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SEC5	P89102	971 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CUR1	Q06469	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	COX4	P04037	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MAS1	P10507	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ALG1	P16661	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PEX1	P24004	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VMA3	P25515	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CDC15	P27636	974 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	COY1	P34237	679 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	UBP13	P38187	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	YTA12	P40341	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TAF1	P46677	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ADA2	Q02336	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PSR2	Q07949	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TMA16	Q08687	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	AFT2	Q08957	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	REC8	Q12188	680 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CAN1	P04817	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	FUS1	P11710	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VPS3	P23643	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SGF29	P25554	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PEX34	P25584	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MLF3	P32047	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MET4	P32389	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SMC1	P32908	1225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TRM2	P33753	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VID24	P38263	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SIP3	P38717	1229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	DYS1	P38791	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SSN3	P39073	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	HXT8	P40886	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	GYP8	P43570	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	OSW7	P43611	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
REI1	YBR267W	AVT1	P47082	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TPO2	P53283	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CAF120	P53836	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
REI1	YBR267W	SFB2	P53953	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	EEB1	Q02891	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MPD2	Q99316	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	FOB1	O13329	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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