RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W SIC1P38634 284 aa5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W HOS4P40480 1083 aa5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W DJP1P40564 432 aa5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W UBP6P43593 499 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W VPS73P53142 486 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W NDJ1Q12366 352 aa5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POP4YBR257W VPS24P36095 224 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
POP4YBR257W TAF5P38129 798 aa5.36□□□□□ -1.55
POP4YBR257W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
POP4YBR257W CRR1Q05790 422 aa5.36□□□□□ -1.55
POP4YBR257W RAD4P14736 754 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W ARE1P25628 610 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W BCD1P38772 366 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W PZF1P39933 429 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W YIR042CP40586 236 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W AMA1P50082 593 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W TAF8Q03750 510 aa5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
POP4YBR257W PRC1P00729 532 aa5.34□□□□□ -1.55
POP4YBR257W LAT1P12695 482 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
POP4YBR257W BET3P36149 193 aa5.34□□□□□ -1.55
POP4YBR257W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
POP4YBR257W TY4A-JP47023 414 aa5.34□□□□□ -1.55
POP4YBR257W RIA1P53893 1110 aa5.34□□□□□ -1.55
POP4YBR257W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SCT1P32784 759 aa5.33□□□□□ -1.56
POP4YBR257W ESL2P36168 1195 aa5.33□□□□□ -1.56
POP4YBR257W HXT16P47185 567 aa5.33□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SPO75Q07798 868 aa5.33□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YRF1-4O13559 1382 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YML133CQ03099 1374 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YLL067CQ07888 1374 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YLL066CQ99208 1374 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W CIT1P00890 479 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W PPZ2P33329 710 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W MPP10P47083 593 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa5.32□□□□□ -1.56
POP4YBR257W HIR1P32479 840 aa5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W FMP52P40008 231 aa5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W CCT7P42943 550 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W NIT3P49954 291 aa5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W TEL2P53038 688 aa5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W RTA1P53047 317 aa5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SGO1Q08490 590 aa5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
POP4YBR257W MET6P05694 767 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W GFA1P14742 717 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SPE2P21182 396 aa5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W BAP3P41815 604 aa5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W UBC11P52492 156 aa5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W IMO32P53219 342 aa5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W RSC3Q06639 885 aa5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
POP4YBR257W KRE5P22023 1365 aa5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W HSP60P19882 572 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W HIS7P33734 552 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YIL092WP40497 633 aa5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.29□□□□□ -1.56not detected
POP4YBR257W NNF1P47149 201 aa5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W TEX1P53851 422 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W USO1P25386 1790 aa5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SIR4P11978 1358 aa5.29□□□□□ -1.56
POP4YBR257W TUB1P09733 447 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W KIN3P22209 435 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W NGG1P32494 702 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W UBS1P38290 277 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W SET5P38890 526 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W YDR338CQ05497 695 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W MET7Q08645 548 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W OSH2Q12451 1283 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W MET5P47169 1442 aa5.28□□□□□ -1.56
POP4YBR257W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W MDM10P18409 493 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W ADY2P25613 283 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W EMP70P32802 667 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W SAP190P36123 1033 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W SNM1P40993 198 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W TIM54P47045 478 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W YGR125WP53273 1036 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W ARO10Q06408 635 aa5.27□□□□□ -1.57
POP4YBR257W BCK1Q01389 1478 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W SIR3P06701 978 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W TOM70P07213 617 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W OCA5P38738 679 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W ALG2P43636 503 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W ZIP2P53061 704 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W ATP25Q03153 612 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W TAF3Q12297 353 aa5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
POP4YBR257W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POP4YBR257W LYS9P38999 446 aa5.25□□□□□ -1.57
POP4YBR257W DAM1P53267 343 aa5.25□□□□□ -1.57
POP4YBR257W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POP4YBR257W REH1Q06709 432 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.2 ms