RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K GAC1P28006 793 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K HIR1P32479 840 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SWI3P32591 825 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K PEP7P32609 515 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM32P32644 1121 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K FRE1P32791 686 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K TKL2P33315 681 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K POL12P38121 705 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K KTR4P38131 464 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YBL036CP38197 257 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SAF1P38352 637 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM4P38741 713 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR054CP38780 354 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K GIP4P39732 760 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NPP2P39997 493 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K FTR1P40088 404 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K TAF1P46677 1066 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K DAS1P47005 663 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SMC3P47037 1230 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K VTC4P47075 721 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS25P47142 202 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K LSC2P53312 427 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CWC24P53769 259 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CAF120P53836 1060 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K MFB1Q04922 465 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YML053CQ04978 212 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K HRQ1Q05549 1077 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CUR1Q06469 252 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NSE1Q07913 336 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K AFT2Q08957 416 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K GPM2Q12008 311 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR027CQ12079 277 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YRR1Q12172 810 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K MED1Q12321 566 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NDJ1Q12366 352 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K MOT1P32333 1867 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K GAL10P04397 699 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K TPK1P06244 397 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K OM45P16547 393 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K VMA4P22203 233 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K TSA1P34760 196 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR225WP38321 900 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SFB3P38810 929 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K FMO1P38866 432 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K AVT2P39981 480 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC1P40986 491 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SBE2P42223 864 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K PFD1P46988 109 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS70P47161 811 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR237CP50089 785 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K FAR11P53917 953 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL011CP53980 444 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K STE20Q03497 939 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K TCO89Q08921 799 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K APC11Q12157 165 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K MRM1P25270 412 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K PDC6P26263 563 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD16P31244 790 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K DAL1P32375 460 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC11P32458 415 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K GYP6P32806 458 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC25P35718 212 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K BCH2P36122 765 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC27P38042 758 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CBR1P38626 284 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP60P39705 539 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SAH1P39954 449 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YER130CP39959 443 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K RSM25P40496 264 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CHS6P40955 746 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K LSB6P42951 607 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K IES1P43579 692 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K ASG7P46993 209 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CPR7P47103 393 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K ATH1P48016 1211 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K PSP1P50896 841 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NMA2P53204 395 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K NIS1P53939 407 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K SEG1Q04279 960 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K TMN2Q04562 672 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K DON1Q05610 365 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)KtW(CCA)K BSP1Q06604 576 aa2.81□□□□□ -1.96
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