RNA–Protein interactions for RNA: YKL112W

ABF1, Transcript of DNA binding protein with possible chromatin-reorganizing activity, yeast

Gene ABF1, Length 2,196 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ABF1	YKL112W	EPL1	P43572	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	MET12	P46151	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	MIG2	P53035	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	SAP4	P53036	818 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	ARP5	P53946	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	RRN5	Q02983	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	MUB1	Q03162	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	LOT6	Q07923	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	SUT2	Q12286	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABF1	YKL112W	ARG81	P05085	880 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	IMP2'	P32351	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	MCM10	P32354	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	DAL1	P32375	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	TIM23	P32897	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	BAP2	P38084	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SPT8	P38915	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	MTW1	P39731	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	MLH2	Q07980	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CIR2	Q08822	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	PHO8	P11491	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	KSS1	P14681	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	JEM1	P40358	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	NDC80	P40460	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	NEO1	P40527	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	INP52	P50942	1183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	MDR1	P53258	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	YGR266W	P53326	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	IRC4	Q03036	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	GNT1	Q12096	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	WSC3	Q12215	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	LYP1	P32487	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	FBP26	P32604	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	DOM34	P33309	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	PTH2	P34222	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	ALG14	P38242	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	RGA1	P39083	1007 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	AFG3	P39925	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	VAB2	P40003	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	YJR061W	P40355	935 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	PKP1	P40530	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	MMM1	P41800	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	YML6	P51998	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	INP2	Q03824	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	DON1	Q05610	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	RSC3	Q06639	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	THI3	Q07471	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SDH5	Q08230	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	HAP4	P14064	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	OM45	P16547	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	VAN1	P23642	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	VPS3	P23643	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	RSM22	P36056	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	FYV10	P40492	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	INA22	P40576	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CIT3	P43635	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SPP1	Q03012	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	RMD1	Q03441	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	PML39	Q03760	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	GYP1	Q08484	637 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SWI1	P09547	1314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CHS3	P29465	1165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SRB4	P32569	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	MCD4	P36051	919 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CCZ1	P38273	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SNZ3	P43545	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	JJJ2	P46997	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SNX4	P47057	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	PIP2	P52960	996 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SNZ2	P53824	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	ADY3	Q07732	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	PSR2	Q07949	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	DAP1	Q12091	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABF1	YKL112W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms