RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	XRS2	P33301	854 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	DID4	P36108	232 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	SEC9	P40357	651 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	VHR1	P40522	640 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	ROG3	P43602	733 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	NUT1	P53114	1132 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	PCL10	P53124	433 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	SEC5	P89102	971 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	VTC3	Q02725	835 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	WTM2	Q12206	467 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	SEM1	O94742	89 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	MCM1	P11746	286 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	PMS1	P14242	873 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	DAL7	P21826	554 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	POL4	P25615	582 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	FBP26	P32604	452 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	HXT13	P39924	564 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	RIC1	P40395	1056 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	ALG2	P43636	503 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	HXT17	P53631	564 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	HXT15	P54854	567 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	SPP1	Q03012	353 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL050C	YKL050C	DAL80	P26343	269 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	DAL3	P32459	195 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RTG1	P32607	177 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SLC1	P33333	303 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YKL107W	P34251	309 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	GAD1	Q04792	585 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RGA2	Q06407	1009 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	REX3	Q12090	404 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MSN1	P22148	382 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RIB7	P33312	244 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	FTH1	P38310	465 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PPE1	P38796	400 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PEX28	P38848	579 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YTA6	P40328	754 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	AIM14	P53109	570 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	TIM10	P87108	93 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SKY1	Q03656	742 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	AOS1	Q06624	347 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	HIM1	Q06674	414 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	VHS3	Q08438	674 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MTH1	P35198	433 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PAN5	P38787	379 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RGA1	P39083	1007 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MBP1	P39678	833 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YEL068C	P39977	110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SMK1	P41808	388 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	TEP1	P53916	434 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.01	□□□□□ -1.77	not detected
YKL050C	YKL050C	STE6	P12866	1290 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ENA1	P13587	1091 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YKU70	P32807	602 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MDL1	P33310	695 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MCD4	P36051	919 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PET10	P36139	283 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YBR284W	P38150	797 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CIR1	P42940	261 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YGR153W	P48238	217 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	KIN4	Q01919	800 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	FCP1	Q03254	732 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MLH2	Q07980	695 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	APL4	Q12028	832 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SEC61	P32915	480 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CCZ1	P38273	704 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	TOS1	P38288	455 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YLF2	P38746	405 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YHR131C	P38835	850 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SPT8	P38915	602 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	TOK1	P40310	691 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	BNI4	P53858	892 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SFB2	P53953	876 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	DFG5	Q05031	458 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PMT7	Q06644	662 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ISA2	Q12425	185 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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