RNA–Protein interactions for RNA: YJR143C

PMT4, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT4, Length 2,289 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT4	YJR143C	DCS2	Q12123	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	GLO4	Q12320	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ADD66	P36040	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YIL092W	P40497	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CBK1	P53894	756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CKA1	P15790	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	TFB1	P32776	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	EMC3	P36039	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	HNT2	P49775	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YNR040W	P53736	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ALF1	P53904	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
PMT4	YJR143C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RNH1	Q04740	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RSC2	Q06488	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CHD1	P32657	1468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PMS1	P14242	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PHO3	P24031	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	DBF4	P32325	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	REC104	P33323	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	STE13	P33894	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YLF2	P38746	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PNT1	P38969	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YJL068C	P40363	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	LYS14	P40971	790 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SLS1	P42900	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	POL31	P46957	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SKP1	P52286	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	GNT1	Q12096	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ADH4	P10127	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ROX1	P25042	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RAD51	P25454	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	NGG1	P32494	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ALG3	P38179	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SHU2	P38957	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	GCD10	P41814	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	BNA2	P47125	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	NFI1	Q12216	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	STF1	P01098	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SGF29	P25554	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SPO74	P45819	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	TIM50	Q02776	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	NUC1	P08466	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	MNE1	P24720	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YKL151C	P36059	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SET3	P36124	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	NPR3	P38742	1146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	VNX1	P42839	908 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SKP2	P42843	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	DAM1	P53267	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ARP9	Q05123	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
PMT4	YJR143C	RGD1	P38339	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PCL7	P40186	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CTF18	P49956	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RAD33	Q04231	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SNO4	Q04902	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SWA2	Q06677	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	HSP32	Q08992	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ARG3	P05150	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	FUS1	P11710	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CDC26	P14724	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	SEC65	P29478	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	IME2	P32581	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	MDL1	P33310	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	RIB7	P33312	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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