RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	ALY2	P47029	1046 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	MTC3	P53077	123 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	NHX1	Q04121	633 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	THI22	Q06490	572 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	CTT1	P06115	562 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	HMG1	P12683	1054 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	DAL7	P21826	554 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	AEP2	P22136	580 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	YHL012W	P38709	493 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	BOI2	P39969	1040 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	TAD1	P53065	400 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	MDG1	P53885	366 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	SFB2	P53953	876 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	YNL034W	P53963	612 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	YNL018C	P53976	612 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	TGL2	P54857	326 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	EAR1	Q03212	550 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	ATG16	Q03818	150 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	YDL144C	Q07589	356 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	RTT109	Q07794	436 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	GAS5	Q08193	484 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	SSP2	Q08646	371 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	OSW2	Q12202	724 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	PHM7	Q12252	991 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	DPH6	Q12429	685 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CIA2	YHR122W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	RSC6	P25632	483 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	DPB3	P27344	201 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	FUN30	P31380	1131 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YKL222C	P35995	705 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YKE2	P52553	114 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YNR014W	P53719	212 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	KIN4	Q01919	800 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	RMP1	Q12530	201 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SFA1	P32771	386 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	NPP2	P39997	493 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YGR153W	P48238	217 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	ACE2	P21192	770 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SAP190	P36123	1033 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	HSL7	P38274	827 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	TDA3	P38758	523 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	MAM1	P40065	302 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	CEP3	P40969	608 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SHR5	P41912	237 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	HPF1	Q05164	967 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	IRC3	Q06683	689 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SVS1	Q12254	260 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	DIF1	O13577	133 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	ENA1	P13587	1091 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YCL002C	P25565	263 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	TRK2	P28584	889 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	MDL2	P33311	773 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	DID4	P36108	232 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	PFF1	P38244	976 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	MMM1	P41800	426 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	NIT2	P47016	307 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	PIP2	P52960	996 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SDH1	Q00711	640 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	MET14	Q02196	202 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	PKH1	Q03407	766 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YVC1	Q12324	675 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	LYS2	P07702	1392 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	SAM35	P14693	329 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	RPC82	P32349	654 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	DAL3	P32459	195 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	HSP78	P33416	811 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	NIC96	P34077	839 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	RET2	P43621	546 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	HFM1	P51979	1187 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	YGR021W	P53212	290 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	BUD9	P53226	547 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CIA2	YHR122W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.67	□□□□□ -1.5	not detected

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