RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CDC33P07260 213 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W MAS2P11914 482 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W NAT1P12945 854 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W RPO26P20435 155 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CDC11P32458 415 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W SWI3P32591 825 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W TMT1P32643 299 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W BLI1P35727 113 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W EXO5P38289 585 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CCT4P39078 528 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W FTR1P40088 404 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data10.05□□□□□ -0.8 RIP-Chip
BRR1YPR057W SGM1P47166 707 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CLA4P48562 842 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W TBF1Q02457 562 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W YML020WQ03722 664 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W YMR018WQ04364 514 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W RGA2Q06407 1009 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W ATG23Q06671 453 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W GIS3Q12418 502 aa10.05□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W GFA1P14742 717 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CDC42P19073 191 aa10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CNS1P33313 385 aa10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W BCH2P36122 765 aa10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W MAD1P40957 749 aa10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CPR7P47103 393 aa10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CWC22P53333 577 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W TRS130Q03660 1102 aa10.04□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W IME1P21190 360 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W DAL2P25335 343 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W CSG2P35206 410 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W MRX3P38172 270 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W VID24P38263 362 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W PSY2P40164 858 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W PPM1Q04081 328 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W RMP1Q12530 201 aa10.03□□□□□ -0.8
BRR1YPR057W SCJ1P25303 377 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W GPT2P36148 743 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W MMS4P38257 691 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W RCK2P38623 610 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W DAS1P47005 663 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W JJJ1P53863 590 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W MSC2Q03455 724 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ICL2Q12031 575 aa10.02□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W CBF2P32504 956 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W TDA3P38758 523 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YTA12P40341 825 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W TPO2P53283 614 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W STE20Q03497 939 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W VTI1Q04338 217 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SHS1Q07657 551 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ATG11Q12527 1178 aa10.01□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W RPS3P05750 240 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W WHI2P12611 486 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SNA3P14359 133 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W COX11P19516 300 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W AFT1P22149 690 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W DBP1P24784 617 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W GCG1P32656 232 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SKP2P42843 763 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SAD1P43589 448 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W PHO86P46956 311 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W URH1Q04179 340 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W NUR1Q12066 484 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ZPS1Q12512 249 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa10□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W RNR1P21524 888 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W MSS51P32335 436 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W BCS1P32839 456 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W DYS1P38791 387 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W SPC72P39723 622 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.99□□□□□ -0.81not detected
BRR1YPR057W DRN1P53255 507 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YGR111WP53265 400 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YDR222WQ04925 415 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ZRT2Q12436 422 aa9.99□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YLR462WO13556 202 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W CDC8P00572 216 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ASP3-2P0CX77 362 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ASP3-3P0CX78 362 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ASP3-4P0CX79 362 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W ASP3-1P0CZ17 362 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W RRN6P32786 894 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W NFU1P32860 256 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W CAB3P36076 571 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W HIS2P38635 335 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YHL049CP38722 271 aa9.98□□□□□ -0.81
BRR1YPR057W YEL075CP39972 122 aa9.98□□□□□ -0.81
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