RNA–Protein interactions for RNA: YMR183C

SSO2, Transcript of Plasma membrane t-SNARE, yeast

Gene SSO2, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSO2	YMR183C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SSO2	YMR183C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSO2	YMR183C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SSO2	YMR183C	ENV7	Q12003	364 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SSO2	YMR183C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CHS7	P38843	316 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CTF8	P38877	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	FLC1	Q08967	793 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	BUL1	P48524	976 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	NIT3	P49954	291 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CTF4	Q01454	927 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	GAL11	P19659	1081 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	MRC1	P25588	1096 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	EMC3	P36039	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	KTR4	P38131	464 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	FOL1	P53848	824 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	DNM1	P54861	757 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	PEX19	Q07418	342 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ADR1	P07248	1323 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CAN1	P04817	590 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	BET3	P36149	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	FUI1	P38196	639 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	YHR078W	P38799	552 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ERP2	P39704	215 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	PUS2	P53167	370 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	DAM1	P53267	343 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ERG5	P54781	538 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	SWM1	Q12379	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	ERG4	P25340	473 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	PAF1	P38351	445 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	TRM11	Q12463	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SSO2	YMR183C	DAL7	P21826	554 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	RAD53	P22216	821 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	DPB3	P27344	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SFP1	P32432	683 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	CTF13	P35203	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	GYP8	P43570	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ALG2	P43636	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	RTA1	P53047	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	NKP1	Q12493	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SUL1	P38359	859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TAD1	P53065	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	REH1	Q06709	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	PEX8	P53248	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ATP25	Q03153	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	NTG2	Q08214	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	OAR1	P35731	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	VHR1	P40522	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	ASI2	P53895	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	RNT1	Q02555	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	TMA17	Q12513	150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	PRC1	P00729	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
SSO2	YMR183C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YCL002C	P25565	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	MSH2	P25847	964 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	SAP190	P36123	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	MOH1	P38191	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	PZF1	P39933	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	DAS1	P47005	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	HLJ1	P48353	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSO2	YMR183C	YGR237C	P50089	785 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.8 ms