RNA–Protein interactions for RNA: YML113W

DAT1, Transcript of DNA binding protein that recognizes oligo(dA).oligo(dT) tracts, yeast

Gene DAT1, Length 747 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DAT1	YML113W	YER186C	P40101	306 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DAT1	YML113W	OSW7	P43611	510 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DAT1	YML113W	ORC5	P50874	479 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DAT1	YML113W	VID30	P53076	958 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DAT1	YML113W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DAT1	YML113W	MNR2	P35724	969 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	HEL1	P36113	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CCL1	P37366	393 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	MMS4	P38257	691 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SHE10	P53075	577 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	COG4	Q06096	861 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	MLH2	Q07980	695 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	PHO13	P19881	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	GCS1	P35197	352 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	APM2	P38700	605 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YLR287C	Q05881	355 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SHS1	Q07657	551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	ESC8	Q08119	714 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SPO11	P23179	398 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	PRR1	P28708	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	RDH54	P38086	958 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	ULI1	P43604	169 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.18	□□□□□ -0.62	not detected
DAT1	YML113W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YGR130C	P53278	816 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YNR014W	P53719	212 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	OSH2	Q12451	1283 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	APL1	P27351	700 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CCC2	P38995	1004 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	EEB1	Q02891	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	ESC2	Q06340	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YCG1	Q06680	1035 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.17	□□□□□ -0.62	RIP-Chip
DAT1	YML113W	APL4	Q12028	832 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CHS2	P14180	963 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	SPC110	P32380	944 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	RAD54	P32863	898 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	XRS2	P33301	854 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	UBP5	P39944	805 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YEL023C	P39992	682 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YIR016W	P40572	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	STB4	P50104	949 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	TIM8	P57744	87 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	ATG9	Q12142	997 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	CIT2	P08679	460 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	PEX2	P32800	271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	TRM2	P33753	639 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	STR2	P47164	639 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	COS5	P47187	383 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	UME1	Q03010	460 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	PIG1	Q06216	648 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DAT1	YML113W	YLR422W	Q06409	1932 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	HAP2	P06774	265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	NIP100	P33420	868 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	VFA1	P40080	203 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	MAF1	P41910	395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	HFM1	P51979	1187 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.14	□□□□□ -0.63	not detected
DAT1	YML113W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	EFM2	P38347	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	NPP2	P39997	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	LCB2	P40970	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	YPR078C	Q06813	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	PLP2	Q12017	286 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	HMI1	Q12039	706 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	REC8	Q12188	680 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	MNL2	Q12205	849 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	YOL098C	Q12496	1037 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	ATG3	P40344	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	SMC3	P47037	1230 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	YJL045W	P47052	634 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	YML083C	Q04526	418 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	SDH5	Q08230	162 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DAT1	YML113W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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