RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W RAM2P29703 316 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W NAM7P30771 971 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W MMS4P38257 691 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W UBP5P39944 805 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W BUD6P41697 788 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W GUP1P53154 560 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W CWC24P53769 259 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W NIS1P53939 407 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W TMN2Q04562 672 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W DCS2Q12123 353 aa10.11□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W GAL80P04387 435 aa10.1□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W SIF2P38262 535 aa10.1□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W TOF1P53840 1238 aa10.1□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W CTF3Q12748 733 aa10.1□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W PEP7P32609 515 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W YSC83P32792 385 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W TRM2P33753 639 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W PET10P36139 283 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W LSB3P43603 459 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W CDD1Q06549 142 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W PTC5Q12511 572 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W NBL1Q3E7Y6 73 aa10.09□□□□□ -0.79
YLR349WYLR349W STE11P23561 717 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W KIP1P28742 1111 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ASF1P32447 279 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W VPS35P34110 944 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W SFB3P38810 929 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W FMO1P38866 432 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W VTC2P43585 828 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data10.08□□□□□ -0.8not detected
YLR349WYLR349W POL31P46957 487 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W HRT3Q12347 344 aa10.08□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ALG1P16661 449 aa10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W MCM3P24279 971 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W MNN4P36044 1178 aa10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YBR056WP38081 501 aa10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W NMD3P38861 518 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W FYV8P46949 817 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ASN1P49089 572 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W HER2Q03557 464 aa10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YDL057WQ07379 328 aa10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YRR1Q12172 810 aa10.07□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W VPS3P23643 1011 aa10.06□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W NUP82P40368 713 aa10.06□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W TAF1P46677 1066 aa10.06□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W BFA1P47113 574 aa10.06□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W CTF18P49956 741 aa10.06□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W GYP8P43570 497 aa10.05□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W CET1O13297 549 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W SLA2P33338 968 aa10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YHL017WP38745 532 aa10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W PSP1P50896 841 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W UBA2P52488 636 aa10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W SHE10P53075 577 aa10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W UTP8P53276 713 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YPQ1Q12010 308 aa10.04□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ASP3-2P0CX77 362 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ASP3-3P0CX78 362 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ASP3-4P0CX79 362 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W ASP3-1P0CZ17 362 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W CKA2P19454 339 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YEL1P34225 687 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W RGD1P38339 666 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YHR054CP38780 354 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W CHS6P40955 746 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W YPR084WQ06821 456 aa10.03□□□□□ -0.8
YLR349WYLR349W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W ISF1P32488 338 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W SPT23P35210 1082 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W TBS1P38114 1094 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W PPS1P38148 807 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W UBP13P38187 747 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W NEM1P38757 446 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W IES1P43579 692 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W TUB4P53378 473 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W MPD2Q99316 277 aa10.02□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W TPK1P06244 397 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W PCK1P10963 549 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W PPH22P23595 377 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W RAD16P31244 790 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W BCH2P36122 765 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W AGP2P38090 596 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W BSP1Q06604 576 aa10.01□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W SSB1P11484 613 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W YBL036CP38197 257 aa10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W BIM1P40013 344 aa10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W SSB2P40150 613 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W TGL3P40308 642 aa10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W VPS25P47142 202 aa10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W RTC4P53850 401 aa10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W SEC5P89102 971 aa10□□□□□ -0.81
YLR349WYLR349W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40 ms