RNA–Protein interactions for RNA: YLL039C

UBI4, Transcript of Ubiquitin, yeast

Gene UBI4, Length 1,146 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBI4	YLL039C	ASF1	P32447	279 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	REG2	P38232	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	RFC5	P38251	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SUL1	P38359	859 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	NTA1	P40354	457 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SMC3	P47037	1230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	NPA3	P47122	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	RET3	P53600	189 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SPO71	Q03868	1245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	OXR1	Q08952	273 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	ARP6	Q12509	438 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YUR1	P26725	428 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PAH1	P32567	862 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	TFC4	P33339	1025 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SAS3	P34218	831 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	AIM21	P40563	679 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	CTR1	P49573	406 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YNR065C	P53751	1116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	ORC4	P54791	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	CSM3	Q04659	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PNP1	Q05788	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	DCS2	Q12123	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SUT2	Q12286	268 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	BIK1	P11709	440 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	ERS1	P17261	260 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	RPB10	P22139	70 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	MSP1	P28737	362 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	BCS1	P32839	456 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	MAL33	P38157	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	TCD1	P38756	429 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	CIT3	P43635	486 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	VPS53	P47061	822 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YJR107W	P47145	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YJR124C	P47159	448 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SCS3	P53012	380 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PEX14	P53112	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	VPS62	P53285	467 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	FAR11	P53917	953 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	TRS120	Q04183	1289 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YMR321C	Q04898	105 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	TIP41	Q12199	356 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	TRM11	Q12463	433 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	POX1	P13711	748 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	RDS1	P25611	832 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	TIM23	P32897	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	UBP11	P36026	717 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	AFG3	P39925	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	NEO1	P40527	1151 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	AIM33	Q04516	312 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	PHM6	Q05637	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	GLO4	Q12320	285 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	YOR131C	Q12486	218 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UBI4	YLL039C	ALG1	P16661	449 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	RRN6	P32786	894 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	GAA1	P39012	614 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	SKP2	P42843	763 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	RTC4	P53850	401 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	MFM1	Q02783	413 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	PTC5	Q12511	572 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	LSO1	Q3E827	93 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	GSY1	P23337	708 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	MBR1	P23493	339 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	UIP5	P36137	443 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	TVP38	P36164	337 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UBI4	YLL039C	RAD55	P38953	406 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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