RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	POP2	P39008	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YIL165C	P40446	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	ERP6	P53198	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YGR130C	P53278	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YNL034W	P53963	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YNL018C	P53976	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	HFD1	Q04458	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	ESC2	Q06340	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
KTR2	YKR061W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	RAD51	P25454	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	EUG1	P32474	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	SUV3	P32580	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	NIC96	P34077	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	PPT1	P53043	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YNL193W	P53870	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	CDC55	Q00362	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	MLC2	Q06580	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	SSP2	Q08646	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	CYC7	P00045	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	MRP7	P12687	371 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	RED1	P14291	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	PLC1	P32383	869 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	HSP78	P33416	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	RKM3	P38222	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YBR197C	P38306	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	BSD2	P38356	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	AKR1	P39010	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	VPS8	P39702	1274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YNL011C	P53980	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	SOG2	Q08817	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	LAP2	Q10740	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	STF1	P01098	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	ARE1	P25628	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	DBF20	P32328	564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	TFC4	P33339	1025 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YBR184W	P38299	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	HXT8	P40886	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	KEL2	P50090	882 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	TIM50	Q02776	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	NSE5	Q03718	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	SCM3	Q12334	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR2	YKR061W	PHO81	P17442	1178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	IME2	P32581	645 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	MRP8	P35719	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YKL069W	P36088	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PAN5	P38787	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	FIR1	P40020	876 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	JEM1	P40358	645 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YIL166C	P40445	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	IRR1	P40541	1150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BNA1	P47096	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YML6	P51998	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YBP2	P53169	641 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	EAF1	Q06337	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PGC1	Q08959	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SPO21	Q12411	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RIM15	P43565	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BAS1	P22035	811 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	APN1	P22936	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	RER1	P25560	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	PGS1	P25578	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BAP2	P38084	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BCD1	P38772	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	GPG1	P53130	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SGD1	Q06132	899 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YLH47	Q06493	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	GIC2	Q06648	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	FMP25	Q08023	583 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR2	YKR061W	SDH5	Q08230	162 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70 ms