RNA–Protein interactions for RNA: YJR143C

PMT4, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT4, Length 2,289 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT4	YJR143C	LAM1	P38851	1228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TOK1	P40310	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SMK1	P41808	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ASK10	P48361	1146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ATP25	Q03153	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	OMS1	Q06668	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ADY3	Q07732	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HFI1	Q12060	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SEM1	O94742	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CDC16	P09798	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HSF1	P10961	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PDX1	P16451	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CBP3	P21560	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NPP1	P25353	742 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ERG3	P32353	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YBR225W	P38321	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	VPS41	P38959	992 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YJL055W	P47044	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	LCD1	Q04377	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	VID22	Q05934	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MTF2	P10849	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PER1	P25625	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	OAF3	P36023	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	VRP1	P37370	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YBL086C	P38177	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YBR287W	P38355	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	TDA3	P38758	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SSN3	P39073	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CIT3	P43635	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HAP5	Q02516	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	VHS3	Q08438	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	SLC1	P33333	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NPR2	P39923	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PUS5	Q06244	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MET7	Q08645	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NUR1	Q12066	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	REX3	Q12090	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	APM4	Q99186	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ADP1	P25371	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	DAL1	P32375	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	XRS2	P33301	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	ZIP2	P53061	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	GUP1	P53154	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	EAR1	Q03212	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MFB1	Q04922	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YCL049C	P25577	312 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YRO2	P38079	344 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	HSL7	P38274	827 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	IFA38	P38286	347 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NEM1	P38757	446 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	EAF5	P39995	279 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	YER010C	P40011	234 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	PUG1	P40100	303 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	JJJ2	P46997	583 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	MAD3	P47074	515 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	GYP1	Q08484	637 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	WSC3	Q12215	556 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMT4	YJR143C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
PMT4	YJR143C	MET17	P06106	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	CMP2	P14747	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	REC107	P21651	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	UGA3	P26370	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	APM3	P38153	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YHR202W	P38887	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	HXT16	P47185	567 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ENV11	P53246	860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ZDS2	P54786	942 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	YHM2	Q04013	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	NHX1	Q04121	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMT4	YJR143C	ENV7	Q12003	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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