RNA–Protein interactions for RNA: YJL188C

BUD19, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene BUD19, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD19	YJL188C	MUP1	P50276	574 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	RSC3	Q06639	885 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	FLC1	Q08967	793 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YLR415C	O13578	112 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	TOP3	P13099	656 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	MTH1	P35198	433 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	SAP190	P36123	1033 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	PPS1	P38148	807 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YIR042C	P40586	236 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	ATP25	Q03153	612 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	THI21	Q08975	551 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	SPC42	P36094	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	SDS3	P40505	327 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	ALG2	P43636	503 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	TAD1	P53065	400 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	RIA1	P53893	1110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	MUK1	Q02866	612 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	NRG1	Q03125	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YML122C	Q03207	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YBR053C	P38235	358 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YBR259W	P38338	688 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	SAK1	P38990	1142 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	YJL163C	P46996	555 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	GND2	P53319	492 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	CRR1	Q05790	422 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	GYP8	P43570	497 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	MRPS35	P53292	345 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BUD19	YJL188C	GAL11	P19659	1081 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	SIC1	P38634	284 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	ECM1	P39715	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	PFA3	P42836	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	CAN1	P04817	590 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	CDC43	P18898	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	YCL002C	P25565	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	ATF1	P40353	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	SHR5	P41912	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	HUL5	P53119	910 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	SGO1	Q08490	590 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	MET7	Q08645	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
BUD19	YJL188C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	DIF1	O13577	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
BUD19	YJL188C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
BUD19	YJL188C	SPC29	P33419	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	BET3	P36149	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	NNF1	P47149	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	ZIP2	P53061	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	FMP52	P40008	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	YBP2	P53169	641 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	YAP1802	P53309	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	SSL2	Q00578	843 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	BDF2	Q07442	638 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	BAP3	P41815	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	TGL5	Q12043	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	PCL5	P38794	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	REV7	P38927	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	HXT16	P47185	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	UBC11	P52492	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	RTA1	P53047	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	GAD1	Q04792	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	NSE3	Q05541	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	IRC13	Q08630	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	GPR1	Q12361	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	DMC1	P25453	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	HOS4	P40480	1083 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	TEL2	P53038	688 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BUD19	YJL188C	KIN3	P22209	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	BCD1	P38772	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	ALY2	P47029	1046 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	APT2	P36973	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	GDH3	P39708	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	YIL166C	P40445	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BUD19	YJL188C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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