RNA–Protein interactions for RNA: YJL019W

MPS3, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene MPS3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MPS3	YJL019W	YLR462W	O13556	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	NUD1	P32336	851 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SEG2	P34250	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PPS1	P38148	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YHL049C	P38722	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	UBP5	P39944	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YEL076C	P39971	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YEL075C	P39972	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YER189W	P40104	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YFL064C	P43540	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	BRO1	P48582	844 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SHR3	Q02774	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	GTB1	Q04924	702 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ENV9	Q08651	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TCO89	Q08921	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PEP5	P12868	1029 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SPO16	P17122	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	RGR1	P19263	1082 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	AMS1	P22855	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	EUG1	P32474	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MRE11	P32829	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YKL050C	P35736	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YKR075C	P36155	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MMS21	P38632	267 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TDA11	P38854	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	BEM4	P39011	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PSY2	P40164	858 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ATP25	Q03153	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ARO80	Q04052	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SLP1	Q12232	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	GSY1	P23337	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TOA1	P32773	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TFC4	P33339	1025 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	VPS35	P34110	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	HSM3	P38348	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	HIS2	P38635	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SPC72	P39723	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YFH7	P43591	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	HPC2	Q01448	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	IRC4	Q03036	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	INP2	Q03824	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MED1	Q12321	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	CLN3	P13365	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TYR1	P20049	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	CBF2	P32504	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ECM4	P36156	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ERP5	P38819	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ROG3	P43602	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	COS5	P47187	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MSN5	P52918	1224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ZIP2	P53061	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ATG1	P53104	897 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	GUP1	P53154	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ACM1	Q08981	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	YVC1	Q12324	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	RTP1	Q12751	981 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PBS2	P08018	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SEC2	P17065	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	KIP2	P28743	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	LHS1	P36016	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MPS3	YJL019W	RRT2	P38332	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	LAM1	P38851	1228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	ALG5	P40350	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	NUP82	P40368	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	DOT5	P40553	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	IAH1	P41734	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	TAF6	P53040	516 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	COS6	P53344	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MPS3	YJL019W	PSF3	Q12146	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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