RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
POP4YBR257W MAD1P40957 749 aa5.65□□□□□ -1.5
POP4YBR257W QRI1P43123 477 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
POP4YBR257W CWC24P53769 259 aa5.65□□□□□ -1.5
POP4YBR257W OMS1Q06668 471 aa5.65□□□□□ -1.5
POP4YBR257W PPH3P32345 308 aa5.64□□□□□ -1.51
POP4YBR257W HBS1P32769 611 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
POP4YBR257W SNU71P53207 620 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
POP4YBR257W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
POP4YBR257W GDB1Q06625 1536 aa5.64□□□□□ -1.51
POP4YBR257W CLC1P17891 233 aa5.63□□□□□ -1.51
POP4YBR257W OPY1P38271 328 aa5.63□□□□□ -1.51
POP4YBR257W SIT1P39980 628 aa5.63□□□□□ -1.51
POP4YBR257W SDP1P40479 209 aa5.63□□□□□ -1.51
POP4YBR257W NOP7P53261 605 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
POP4YBR257W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
POP4YBR257W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
POP4YBR257W MCH5Q08777 521 aa5.62□□□□□ -1.51
POP4YBR257W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
POP4YBR257W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W ALG7P07286 448 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W MRP8P35719 219 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W YRO2P38079 344 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W CTF8P38877 133 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W TOK1P40310 691 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W PFD1P46988 109 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W HDA1P53973 706 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W RNT1Q02555 471 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W PDR12Q02785 1511 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W NTE1Q04958 1679 aa5.61□□□□□ -1.51
POP4YBR257W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
POP4YBR257W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
POP4YBR257W KRI1P42846 591 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
POP4YBR257W MRPS35P53292 345 aa5.6□□□□□ -1.51
POP4YBR257W PEX19Q07418 342 aa5.6□□□□□ -1.51
POP4YBR257W CTF13P35203 478 aa5.59□□□□□ -1.51
POP4YBR257W PBY1P38254 753 aa5.59□□□□□ -1.51
POP4YBR257W TCB2P48231 1178 aa5.59□□□□□ -1.51
POP4YBR257W ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
POP4YBR257W YOR093CQ12275 1648 aa5.59□□□□□ -1.52
POP4YBR257W CDC25P04821 1589 aa5.59□□□□□ -1.52
POP4YBR257W IQG1Q12280 1495 aa5.58□□□□□ -1.52
POP4YBR257W MTH1P35198 433 aa5.58□□□□□ -1.52
POP4YBR257W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
POP4YBR257W GND2P53319 492 aa5.58□□□□□ -1.52
POP4YBR257W IRC10Q08118 586 aa5.58□□□□□ -1.52
POP4YBR257W ADE8P04161 214 aa5.57□□□□□ -1.52
POP4YBR257W ATF1P40353 525 aa5.57□□□□□ -1.52
POP4YBR257W YKR011CQ02209 353 aa5.57□□□□□ -1.52
POP4YBR257W ACF2Q12168 779 aa5.57□□□□□ -1.52
POP4YBR257W PPS1P38148 807 aa5.56□□□□□ -1.52
POP4YBR257W VAC8P39968 578 aa5.56□□□□□ -1.52
POP4YBR257W IRR1P40541 1150 aa5.56□□□□□ -1.52
POP4YBR257W URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
POP4YBR257W EAF7P53911 425 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
POP4YBR257W SVF1Q05515 481 aa5.55□□□□□ -1.52
POP4YBR257W FRE5Q08908 694 aa5.55□□□□□ -1.52
POP4YBR257W MMS1Q06211 1407 aa5.55□□□□□ -1.52
POP4YBR257W DNF2Q12675 1612 aa5.55□□□□□ -1.52
POP4YBR257W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W SPO14P36126 1683 aa5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W YBR184WP38299 523 aa5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W LCD1Q04377 747 aa5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W TRM11Q12463 433 aa5.54□□□□□ -1.52
POP4YBR257W DOP1Q03921 1698 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W ELO3P40319 345 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W SDS3P40505 327 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W CEP3P40969 608 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W STU2P46675 888 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W FMP25Q08023 583 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W SUT2Q12286 268 aa5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POP4YBR257W RFA1P22336 621 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W NAP1P25293 417 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W SPC42P36094 363 aa5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W YBR284WP38150 797 aa5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W YIR014WP40570 242 aa5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W YPR071WQ12346 211 aa5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
POP4YBR257W YBR053CP38235 358 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W YHR078WP38799 552 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W FKH2P41813 862 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W VPS30Q02948 557 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W PDS5Q04264 1277 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W ADY4Q05955 493 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W ENV7Q12003 364 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W SWM1Q12379 170 aa5.51□□□□□ -1.53
POP4YBR257W RPP0P05317 312 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POP4YBR257W REC104P33323 182 aa5.5□□□□□ -1.53
POP4YBR257W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POP4YBR257W MUP1P50276 574 aa5.5□□□□□ -1.53
POP4YBR257W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
POP4YBR257W CDC45Q08032 650 aa5.5□□□□□ -1.53
POP4YBR257W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.5□□□□□ -1.53not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.7 ms