RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zkscan8Q8BSL0 588 aa19.58■□□□□ 0.73
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Gsdma2Q32M21 443 aa19.58■□□□□ 0.72
Casq1-201ENSMUST00000003554 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa19.58■□□□□ 0.72
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa19.57■□□□□ 0.72
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nphp3Q7TNH6 1325 aa19.57■□□□□ 0.72
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa19.56■□□□□ 0.72
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam198bQ3UPI1 517 aa19.55■□□□□ 0.72
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Spata31d1bE9QA57 1361 aa19.54■□□□□ 0.72
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc4a1P04919 929 aa19.53■□□□□ 0.72
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Scn11aQ9R053 1765 aa19.52■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm10093D3YYI8 482 aa19.51■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sptbn5F6UCX4 1208 aa19.51■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp2b3Q0VF55 1220 aa19.51■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plbd2Q3TCN2 594 aa19.51■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mctp2Q5RJH2 878 aa19.51■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 ArxO35085 564 aa19.51■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc39a11Q8BWY7 342 aa19.51■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Pde8bE9Q4S1 865 aa19.5■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccne2Q9Z238 404 aa19.5■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 TsksO54887 585 aa19.49■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Popdc2Q9ES82 367 aa19.49■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eva1cP58659 440 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fbxo3Q9DC63 480 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700029H14RikE9PY36 240 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kcnq5Q9JK45 933 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lgr5Q9Z1P4 907 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Col3a1P08121 1464 aa19.48■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ube4aE9Q735 1028 aa19.47■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Jdp2P97875 163 aa19.46■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 1810065E05RikQ5NC41 235 aa19.46■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf496Q5SXI5 585 aa19.46■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sept1P42209 366 aa19.46■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Golim4Q8BXA1 655 aa19.46■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem143Q8VD26 458 aa19.46■□□□□ 0.71
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc6D3YZP9 469 aa19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aknad1E9Q8N6 675 aa19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Apba2P98084 750 aa19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sptlc3Q8BG54 563 aa19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 EngaseQ8BX80 734 aa19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 TnksQ6PFX9 1320 aa19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7347D3YYI9 267 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Speer4aF8VPX6 267 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 CpvlQ9D3S9 478 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 GabrdP22933 449 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mdm2P23804 489 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 NpeppsQ11011 920 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tshz3Q8CGV9 1081 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Top1mtQ8R4U6 593 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rdm1Q9CQK3 281 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mlh1Q9JK91 760 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rgs17Q9QZB0 210 aa19.44■□□□□ 0.7
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4340L7N2C4 268 aa19.43■□□□□ 0.7
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