Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
Ccne2Q9Z238 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ccne2Q9Z238 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ccne2Q9Z238 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccne2Q9Z238 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Ccne2Q9Z238 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Ccne2Q9Z238 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccne2Q9Z238 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccne2Q9Z238 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccne2Q9Z238 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccne2Q9Z238 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccne2Q9Z238 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccne2Q9Z238 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Ccne2Q9Z238 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccne2Q9Z238 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccne2Q9Z238 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccne2Q9Z238 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccne2Q9Z238 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccne2Q9Z238 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccne2Q9Z238 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccne2Q9Z238 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccne2Q9Z238 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccne2Q9Z238 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccne2Q9Z238 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccne2Q9Z238 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccne2Q9Z238 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccne2Q9Z238 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccne2Q9Z238 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccne2Q9Z238 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccne2Q9Z238 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccne2Q9Z238 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccne2Q9Z238 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccne2Q9Z238 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccne2Q9Z238 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccne2Q9Z238 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccne2Q9Z238 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccne2Q9Z238 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccne2Q9Z238 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ccne2Q9Z238 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ccne2Q9Z238 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccne2Q9Z238 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccne2Q9Z238 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccne2Q9Z238 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccne2Q9Z238 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccne2Q9Z238 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccne2Q9Z238 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccne2Q9Z238 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccne2Q9Z238 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccne2Q9Z238 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccne2Q9Z238 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccne2Q9Z238 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccne2Q9Z238 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccne2Q9Z238 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccne2Q9Z238 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccne2Q9Z238 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccne2Q9Z238 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccne2Q9Z238 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccne2Q9Z238 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccne2Q9Z238 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccne2Q9Z238 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccne2Q9Z238 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccne2Q9Z238 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccne2Q9Z238 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccne2Q9Z238 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccne2Q9Z238 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccne2Q9Z238 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccne2Q9Z238 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccne2Q9Z238 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccne2Q9Z238 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccne2Q9Z238 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccne2Q9Z238 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccne2Q9Z238 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccne2Q9Z238 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccne2Q9Z238 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccne2Q9Z238 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccne2Q9Z238 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccne2Q9Z238 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccne2Q9Z238 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccne2Q9Z238 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccne2Q9Z238 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccne2Q9Z238 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccne2Q9Z238 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccne2Q9Z238 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccne2Q9Z238 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccne2Q9Z238 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccne2Q9Z238 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccne2Q9Z238 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccne2Q9Z238 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccne2Q9Z238 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccne2Q9Z238 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccne2Q9Z238 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccne2Q9Z238 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccne2Q9Z238 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccne2Q9Z238 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccne2Q9Z238 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccne2Q9Z238 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccne2Q9Z238 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccne2Q9Z238 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccne2Q9Z238 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccne2Q9Z238 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms