Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
Sept1P42209 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Sept1P42209 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Sept1P42209 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Sept1P42209 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Sept1P42209 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Sept1P42209 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Sept1P42209 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Sept1P42209 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sept1P42209 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Sept1P42209 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Sept1P42209 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Sept1P42209 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Sept1P42209 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Sept1P42209 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Sept1P42209 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sept1P42209 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Sept1P42209 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Sept1P42209 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Sept1P42209 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sept1P42209 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Sept1P42209 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Sept1P42209 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Sept1P42209 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Sept1P42209 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sept1P42209 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sept1P42209 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sept1P42209 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sept1P42209 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Sept1P42209 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Sept1P42209 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sept1P42209 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Sept1P42209 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Sept1P42209 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sept1P42209 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Sept1P42209 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sept1P42209 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sept1P42209 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sept1P42209 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sept1P42209 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sept1P42209 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sept1P42209 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Sept1P42209 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Sept1P42209 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Sept1P42209 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sept1P42209 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sept1P42209 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Sept1P42209 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Sept1P42209 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Sept1P42209 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sept1P42209 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sept1P42209 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sept1P42209 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sept1P42209 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sept1P42209 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Sept1P42209 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Sept1P42209 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sept1P42209 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sept1P42209 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sept1P42209 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sept1P42209 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sept1P42209 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Sept1P42209 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sept1P42209 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Sept1P42209 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sept1P42209 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Sept1P42209 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Sept1P42209 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sept1P42209 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sept1P42209 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sept1P42209 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sept1P42209 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sept1P42209 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Sept1P42209 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sept1P42209 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sept1P42209 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sept1P42209 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sept1P42209 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sept1P42209 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sept1P42209 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sept1P42209 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sept1P42209 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Sept1P42209 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sept1P42209 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Sept1P42209 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sept1P42209 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sept1P42209 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sept1P42209 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Sept1P42209 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sept1P42209 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sept1P42209 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sept1P42209 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sept1P42209 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sept1P42209 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sept1P42209 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sept1P42209 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sept1P42209 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Sept1P42209 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sept1P42209 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sept1P42209 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms