Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
Nphp3Q7TNH6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Nphp3Q7TNH6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Nphp3Q7TNH6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Nphp3Q7TNH6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Nphp3Q7TNH6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Nphp3Q7TNH6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Nphp3Q7TNH6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Nphp3Q7TNH6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Nphp3Q7TNH6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Nphp3Q7TNH6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Nphp3Q7TNH6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Nphp3Q7TNH6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Nphp3Q7TNH6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Nphp3Q7TNH6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Nphp3Q7TNH6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Nphp3Q7TNH6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Nphp3Q7TNH6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Nphp3Q7TNH6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Nphp3Q7TNH6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Nphp3Q7TNH6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nphp3Q7TNH6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Nphp3Q7TNH6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Nphp3Q7TNH6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Nphp3Q7TNH6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Nphp3Q7TNH6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Nphp3Q7TNH6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Nphp3Q7TNH6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Nphp3Q7TNH6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nphp3Q7TNH6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nphp3Q7TNH6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nphp3Q7TNH6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nphp3Q7TNH6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nphp3Q7TNH6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nphp3Q7TNH6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Nphp3Q7TNH6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Nphp3Q7TNH6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nphp3Q7TNH6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nphp3Q7TNH6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nphp3Q7TNH6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nphp3Q7TNH6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Nphp3Q7TNH6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nphp3Q7TNH6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nphp3Q7TNH6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Nphp3Q7TNH6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nphp3Q7TNH6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nphp3Q7TNH6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nphp3Q7TNH6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Nphp3Q7TNH6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nphp3Q7TNH6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nphp3Q7TNH6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nphp3Q7TNH6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Nphp3Q7TNH6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Nphp3Q7TNH6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nphp3Q7TNH6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nphp3Q7TNH6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nphp3Q7TNH6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nphp3Q7TNH6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nphp3Q7TNH6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Nphp3Q7TNH6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nphp3Q7TNH6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nphp3Q7TNH6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Nphp3Q7TNH6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Nphp3Q7TNH6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Nphp3Q7TNH6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nphp3Q7TNH6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nphp3Q7TNH6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Nphp3Q7TNH6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Nphp3Q7TNH6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Nphp3Q7TNH6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nphp3Q7TNH6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
Nphp3Q7TNH6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nphp3Q7TNH6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nphp3Q7TNH6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nphp3Q7TNH6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Nphp3Q7TNH6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Nphp3Q7TNH6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Nphp3Q7TNH6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nphp3Q7TNH6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nphp3Q7TNH6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nphp3Q7TNH6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nphp3Q7TNH6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nphp3Q7TNH6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nphp3Q7TNH6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nphp3Q7TNH6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nphp3Q7TNH6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Nphp3Q7TNH6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nphp3Q7TNH6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nphp3Q7TNH6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nphp3Q7TNH6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nphp3Q7TNH6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms