Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Popdc2Q9ES82 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Popdc2Q9ES82 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Popdc2Q9ES82 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Popdc2Q9ES82 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Popdc2Q9ES82 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Popdc2Q9ES82 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Popdc2Q9ES82 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Popdc2Q9ES82 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Popdc2Q9ES82 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Popdc2Q9ES82 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Popdc2Q9ES82 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Popdc2Q9ES82 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Popdc2Q9ES82 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Popdc2Q9ES82 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Popdc2Q9ES82 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Popdc2Q9ES82 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Popdc2Q9ES82 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Popdc2Q9ES82 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Popdc2Q9ES82 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Popdc2Q9ES82 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Popdc2Q9ES82 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Popdc2Q9ES82 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Popdc2Q9ES82 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Popdc2Q9ES82 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Popdc2Q9ES82 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Popdc2Q9ES82 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Popdc2Q9ES82 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Popdc2Q9ES82 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Popdc2Q9ES82 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Popdc2Q9ES82 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Popdc2Q9ES82 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Popdc2Q9ES82 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Popdc2Q9ES82 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Popdc2Q9ES82 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Popdc2Q9ES82 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Popdc2Q9ES82 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Popdc2Q9ES82 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Popdc2Q9ES82 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Popdc2Q9ES82 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Popdc2Q9ES82 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Popdc2Q9ES82 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Popdc2Q9ES82 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Popdc2Q9ES82 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Popdc2Q9ES82 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Popdc2Q9ES82 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Popdc2Q9ES82 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Popdc2Q9ES82 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Popdc2Q9ES82 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Popdc2Q9ES82 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Popdc2Q9ES82 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Popdc2Q9ES82 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Popdc2Q9ES82 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Popdc2Q9ES82 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Popdc2Q9ES82 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Popdc2Q9ES82 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Popdc2Q9ES82 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Popdc2Q9ES82 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Popdc2Q9ES82 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Popdc2Q9ES82 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Popdc2Q9ES82 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Popdc2Q9ES82 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Popdc2Q9ES82 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Popdc2Q9ES82 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Popdc2Q9ES82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Popdc2Q9ES82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Popdc2Q9ES82 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Popdc2Q9ES82 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Popdc2Q9ES82 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Popdc2Q9ES82 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Popdc2Q9ES82 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Popdc2Q9ES82 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Popdc2Q9ES82 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Popdc2Q9ES82 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Popdc2Q9ES82 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Popdc2Q9ES82 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Popdc2Q9ES82 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Popdc2Q9ES82 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Popdc2Q9ES82 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Popdc2Q9ES82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Popdc2Q9ES82 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Popdc2Q9ES82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Popdc2Q9ES82 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Popdc2Q9ES82 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Popdc2Q9ES82 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Popdc2Q9ES82 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Popdc2Q9ES82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Popdc2Q9ES82 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Popdc2Q9ES82 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Popdc2Q9ES82 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Popdc2Q9ES82 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Popdc2Q9ES82 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Popdc2Q9ES82 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Popdc2Q9ES82 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Popdc2Q9ES82 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Popdc2Q9ES82 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Popdc2Q9ES82 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Popdc2Q9ES82 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Popdc2Q9ES82 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Popdc2Q9ES82 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms