Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
Rbbp8nlA2ABX0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rbbp8nlA2ABX0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rbbp8nlA2ABX0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rbbp8nlA2ABX0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.04■■■■■ 4
Rbbp8nlA2ABX0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rbbp8nlA2ABX0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rbbp8nlA2ABX0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rbbp8nlA2ABX0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Rbbp8nlA2ABX0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rbbp8nlA2ABX0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rbbp8nlA2ABX0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rbbp8nlA2ABX0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rbbp8nlA2ABX0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Rbbp8nlA2ABX0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rbbp8nlA2ABX0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rbbp8nlA2ABX0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rbbp8nlA2ABX0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rbbp8nlA2ABX0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Rbbp8nlA2ABX0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rbbp8nlA2ABX0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rbbp8nlA2ABX0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rbbp8nlA2ABX0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rbbp8nlA2ABX0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rbbp8nlA2ABX0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rbbp8nlA2ABX0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rbbp8nlA2ABX0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rbbp8nlA2ABX0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rbbp8nlA2ABX0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rbbp8nlA2ABX0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rbbp8nlA2ABX0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rbbp8nlA2ABX0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rbbp8nlA2ABX0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rbbp8nlA2ABX0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rbbp8nlA2ABX0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rbbp8nlA2ABX0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Rbbp8nlA2ABX0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rbbp8nlA2ABX0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rbbp8nlA2ABX0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rbbp8nlA2ABX0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rbbp8nlA2ABX0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms