Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
Pde3bQ61409 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Pde3bQ61409 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Pde3bQ61409 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Pde3bQ61409 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Pde3bQ61409 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Pde3bQ61409 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Pde3bQ61409 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Pde3bQ61409 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Pde3bQ61409 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Pde3bQ61409 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Pde3bQ61409 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Pde3bQ61409 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pde3bQ61409 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Pde3bQ61409 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pde3bQ61409 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Pde3bQ61409 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Pde3bQ61409 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pde3bQ61409 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Pde3bQ61409 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pde3bQ61409 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pde3bQ61409 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pde3bQ61409 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pde3bQ61409 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pde3bQ61409 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pde3bQ61409 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Pde3bQ61409 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pde3bQ61409 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pde3bQ61409 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pde3bQ61409 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pde3bQ61409 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pde3bQ61409 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pde3bQ61409 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pde3bQ61409 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pde3bQ61409 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Pde3bQ61409 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pde3bQ61409 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pde3bQ61409 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pde3bQ61409 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pde3bQ61409 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pde3bQ61409 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Pde3bQ61409 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Pde3bQ61409 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pde3bQ61409 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pde3bQ61409 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pde3bQ61409 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pde3bQ61409 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pde3bQ61409 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pde3bQ61409 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pde3bQ61409 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pde3bQ61409 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pde3bQ61409 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pde3bQ61409 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pde3bQ61409 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pde3bQ61409 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pde3bQ61409 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pde3bQ61409 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pde3bQ61409 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pde3bQ61409 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pde3bQ61409 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Pde3bQ61409 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Pde3bQ61409 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pde3bQ61409 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Pde3bQ61409 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pde3bQ61409 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pde3bQ61409 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pde3bQ61409 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pde3bQ61409 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pde3bQ61409 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pde3bQ61409 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pde3bQ61409 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.63■■■■□ 3.14
Pde3bQ61409 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pde3bQ61409 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pde3bQ61409 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pde3bQ61409 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pde3bQ61409 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pde3bQ61409 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde3bQ61409 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pde3bQ61409 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde3bQ61409 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde3bQ61409 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pde3bQ61409 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pde3bQ61409 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pde3bQ61409 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pde3bQ61409 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pde3bQ61409 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pde3bQ61409 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pde3bQ61409 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pde3bQ61409 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pde3bQ61409 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pde3bQ61409 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pde3bQ61409 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pde3bQ61409 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pde3bQ61409 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pde3bQ61409 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pde3bQ61409 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Pde3bQ61409 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pde3bQ61409 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pde3bQ61409 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pde3bQ61409 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms