RNA–Protein interactions for RNA: YNL013C

YNL013C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL013C, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL013C	YNL013C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YNL013C	YNL013C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	TOP3	P13099	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	SED4	P25365	1065 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	TIM54	P47045	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	ENV7	Q12003	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL013C	YNL013C	CIT1	P00890	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	RPD3	P32561	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	SDP1	P40479	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	HDA1	P53973	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	VPS30	Q02948	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	TAF8	Q03750	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	CTF8	P38877	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	CTF4	Q01454	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	AIM39	Q08223	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	FLC1	Q08967	793 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	CEP3	P40969	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
YNL013C	YNL013C	HUL5	P53119	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	GIS1	Q03833	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	BDF2	Q07442	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	BET3	P36149	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	ERG5	P54781	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	EMC3	P36039	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	HUL4	P40985	892 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	GYP8	P43570	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	RTA1	P53047	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL013C	YNL013C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	NSE3	Q05541	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	CAN1	P04817	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	RAD53	P22216	821 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YHR078W	P38799	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	NIT3	P49954	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	PEX19	Q07418	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	GAL11	P19659	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	NNF1	P47149	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	PUS2	P53167	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YNL013C	YNL013C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	CTF13	P35203	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	KTR4	P38131	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	ALG2	P43636	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	TAD1	P53065	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	PPM2	Q08282	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	TRM13	Q12383	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	TRM11	Q12463	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	DAL7	P21826	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	ERG4	P25340	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	SUL1	P38359	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	DAM1	P53267	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	ASI2	P53895	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	SWM1	Q12379	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YCL002C	P25565	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	REH1	Q06709	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	OAR1	P35731	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	MOH1	P38191	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	MRPS35	P53292	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	ATP25	Q03153	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	MET7	Q08645	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL013C	YNL013C	PRC1	P00729	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL013C	YNL013C	SPC29	P33419	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL013C	YNL013C	OCA5	P38738	679 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL013C	YNL013C	VHR1	P40522	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL013C	YNL013C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL013C	YNL013C	RNT1	Q02555	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL013C	YNL013C	OMS1	Q06668	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.6 ms