RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	YKL222C	P35995	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	PEX28	P38848	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	EAF6	P47128	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	HLJ1	P48353	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ESC8	Q08119	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YCR015C	P25616	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SQT1	P35184	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ESL2	P36168	1195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	PMT3	P47190	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YGR053C	P53234	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	JNM1	P36224	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	GEM1	P39722	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YGR237C	P50089	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TMA17	Q12513	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SAM35	P14693	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	MSH2	P25847	964 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	HIR1	P32479	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RDH54	P38086	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	FAA3	P39002	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YHL012W	P38709	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	HUL4	P40985	892 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	MRPL22	P53881	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ADI1	Q03677	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	SND1	Q04007	877 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	NTG2	Q08214	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	LAP2	Q10740	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	NUP145	P49687	1317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	CAN1	P04817	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	CDC11	P32458	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	TFC3	P34111	1160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	PTH2	P34222	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	ATG14	P38270	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	GIP4	P39732	760 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	VID27	P40157	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	UGO1	Q03327	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	BUG1	Q12191	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIR3	YKL163W	CIT1	P00890	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	INH1	P01097	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
PIR3	YKL163W	CTT1	P06115	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	ADD66	P36040	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	HSE1	P38753	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PIC2	P40035	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YJL045W	P47052	634 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	ERP6	P53198	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	UBX4	P54730	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	TFB2	Q02939	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	ATG13	Q06628	738 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	BAS1	P22035	811 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SSH4	P32343	579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	FLR1	P38124	548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YBR184W	P38299	523 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	IES5	P40060	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PEA2	P40091	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	EAF1	Q06337	982 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RTP1	Q12751	981 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	OPI1	P21957	404 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	ARE1	P25628	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SCT1	P32784	759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	AFG2	P32794	780 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	AIM26	P32858	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms