RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	KAR4	P25583	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	PET10	P36139	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	HUL5	P53119	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	ENB1	Q08299	606 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	GUP2	Q08929	609 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	FLC1	Q08967	793 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	NIT3	P49954	291 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	PUS2	P53167	370 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
SFT1	YKL006C-A	YKR011C	Q02209	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SFT1	YKL006C-A	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	TOP3	P13099	656 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	MSS4	P38994	779 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	NNF1	P47149	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	MPH2	P0CD99	609 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
SFT1	YKL006C-A	HDA1	P53973	706 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	PEX19	Q07418	342 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	STE14	P32584	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	SDP1	P40479	209 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	KIN4	Q01919	800 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	SWM1	Q12379	170 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	TAF8	Q03750	510 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	ENV7	Q12003	364 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	YOR131C	Q12486	218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	FBP1	P09201	348 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
SFT1	YKL006C-A	DAL7	P21826	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	SAP190	P36123	1033 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	SUL1	P38359	859 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	CTF4	Q01454	927 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	LAS17	Q12446	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	CAN1	P04817	590 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
SFT1	YKL006C-A	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	YHR078W	P38799	552 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	DAM1	P53267	343 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	YDR514C	Q04408	483 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	NSE3	Q05541	303 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	BDF2	Q07442	638 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SFT1	YKL006C-A	PRC1	P00729	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	GAL11	P19659	1081 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	ERG4	P25340	473 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	BET3	P36149	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	KTR4	P38131	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	CTF8	P38877	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	PZF1	P39933	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	ALG2	P43636	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	TAD1	P53065	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	SLI1	P53304	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	HAL9	Q12180	1030 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YOR022C	Q12204	715 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YCL002C	P25565	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	EMC3	P36039	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	VHR1	P40522	640 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	GYP8	P43570	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	RTA1	P53047	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YLR040C	Q07988	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	TRM11	Q12463	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	NGG1	P32494	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	CTF13	P35203	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	RPP1	P38786	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	SHR5	P41912	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	PKH1	Q03407	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	REH1	Q06709	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YOL073C	Q08232	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	CHS7	P38843	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	SAK1	P38990	1142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	SSY5	P47002	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	RNT1	Q02555	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	YMR206W	Q03695	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	RSC3	Q06639	885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	MET3	P08536	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SFT1	YKL006C-A	RAD53	P22216	821 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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