RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY4A-JP47023 414 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W SIZ1Q04195 904 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W MED7Q08278 222 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W OSW2Q12202 724 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
PRD1YCL057W YGL081WP53156 320 aa5.88□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W ATP25Q03153 612 aa5.88□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W VPS15P22219 1454 aa5.88□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W MSC2Q03455 724 aa5.87□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W ENV11P53246 860 aa5.87□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W DNF1P32660 1571 aa5.86□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W DAM1P53267 343 aa5.86□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TFB2Q02939 513 aa5.86□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W SRM1P21827 482 aa5.86□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W MTC2P34246 357 aa5.86□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W YLR001CQ07895 862 aa5.86□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W YBT1P32386 1661 aa5.85□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W CDC9P04819 755 aa5.85□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W GSY1P23337 708 aa5.85□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W VBA3P25594 458 aa5.85□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W APL1P27351 700 aa5.85□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W GRX4P32642 244 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TOS1P38288 455 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W DSS1P39112 969 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W YNL193WP53870 558 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W RSM24Q03976 319 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W ADR1P07248 1323 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-HO13535 1793 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-JR1P47098 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-ER1Q03612 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-GR2Q12269 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-OLQ12273 1755 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W MPH2P0CD99 609 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W UBP12P39538 1254 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W CTH1P47976 325 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W YPR196WQ06595 470 aa5.84□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.83□□□□□ -1.48not detected
PRD1YCL057W HSP78P33416 811 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W NIT3P49954 291 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W IOC4Q04213 475 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W RSC3Q06639 885 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W MET7Q08645 548 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W SFP1P32432 683 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CDA1Q06702 301 aa5.83□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W SRD1P09007 221 aa5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CRP1P38845 465 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CAF16P43569 289 aa5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W BRE4Q07660 1125 aa5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W VTH1P40438 1549 aa5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W VTH2P40890 1549 aa5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W NUP159P40477 1460 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W NOT3P06102 836 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W YEL1P34225 687 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W HXT16P47185 567 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W HDA1P53973 706 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W YDR514CQ04408 483 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W TY1B-BRQ12193 1756 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W TY1B-GR3Q12316 1755 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W TY1B-ORQ92393 1755 aa5.81□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W SRB8P25648 1427 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W TSR4P25040 408 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W PCL2P25693 308 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W STE13P33894 931 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W MCD4P36051 919 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W INP52P50942 1183 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W REH1Q06709 432 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W STO1P34160 861 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CAB3P36076 571 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W YGR012WP53206 393 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W NOG2P53742 486 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W YDL177CQ12257 170 aa5.8□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W HSF1P10961 833 aa5.79□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W MGS1P40151 587 aa5.79□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W TAD1P53065 400 aa5.79□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W CMP2P14747 604 aa5.78□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W RFA1P22336 621 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W SRP101P32916 621 aa5.78□□□□□ -1.48
PRD1YCL057W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data5.78□□□□□ -1.48not detected
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