RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MLC2	Q06580	163 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	OPY2	Q06810	360 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MPD2	Q99316	277 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	UGA4	P32837	571 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	RER2	P35196	286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MRPL16	P38064	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SEA4	P38164	1038 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	YAP1801	P38856	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	HXT13	P39924	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	HXT17	P53631	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	YNL034W	P53963	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	YNL018C	P53976	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	HXT15	P54854	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	CTR9	P89105	1077 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	COG8	Q04632	607 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	FPS1	P23900	669 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	NIC96	P34077	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	PEX28	P38848	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SKN7	P38889	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SAP185	P40856	1058 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	RSM26	P47141	266 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	RKM4	Q12504	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SPS1	P08458	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	AEP2	P22136	580 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MKK2	P32491	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SWI3	P32591	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	DOM34	P33309	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	GIP1	P38229	639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	AIM46	P38885	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SHU2	P38957	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MEH1	Q02205	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	YML131W	Q03102	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	HDA2	Q06629	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS1B	YML063W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MEF1	P25039	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RPS1B	YML063W	KAP122	P32767	1081 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MUM2	P38236	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	EXO84	P38261	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	APM2	P38700	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YAP3	P38749	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	EMP65	P40085	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	QDR2	P40474	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MON1	P53129	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YNL165W	P53891	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	REH1	Q06709	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SRB8	P25648	1427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	COB	P00163	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	INO1	P11986	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	KCC4	P25389	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RDH54	P38086	958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	ACA1	P39970	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	CNN1	P43618	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	NIT2	P47016	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YNR014W	P53719	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MED1	Q12321	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	RAD53	P22216	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	DBF20	P32328	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TFC4	P33339	1025 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	PEX5	P35056	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YKL050C	P35736	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	YHL041W	P38730	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	CCC2	P38995	1004 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	DSS1	P39112	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TMA108	P40462	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	MNT3	P40549	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	GRC3	Q07845	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS1B	YML063W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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