RNA–Protein interactions for RNA: YLR467W

YRF1-5, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-5, Length 5,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5YLR467W CIK1Q01649 594 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W YLR177WQ06251 628 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W UGA2P38067 497 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W YLH47Q06493 454 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W MET7Q08645 548 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W CCC2P38995 1004 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W YGR016WP53209 190 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W ORM2Q06144 216 aa8.17□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W THR4P16120 514 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W ARB1P40024 610 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SUM1P46676 1062 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W RBL2P48606 106 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W LSC2P53312 427 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W HPC2Q01448 625 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SEC18P18759 758 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W IME1P21190 360 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W RPS5P26783 225 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W RIB7P33312 244 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W MCD4P36051 919 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SIP5P40210 489 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W YRF1-1P0CX20 1796 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W YRF1-5P0CX21 1796 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W YRF1-8P0CX22 1796 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SBP1P10080 294 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W PRI1P10363 409 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W GCD6P32501 712 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W CSM3Q04659 317 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W PNP1Q05788 311 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SSB1P11484 613 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W SSB2P40150 613 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W PCL10P53124 433 aa8.16□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W DCD1P06773 312 aa8.15□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W RCR1P38212 213 aa8.15□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W EPS1P40557 701 aa8.15□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W BCP1Q06338 283 aa8.15□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W RLP7P40693 322 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
YRF1-5YLR467W MCM3P24279 971 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W NIP1P32497 812 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W CCL1P37366 393 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W TAF1P46677 1066 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W PLP1Q04004 230 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YLR125WQ12138 136 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W TCB1Q12466 1186 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W SEM1O94742 89 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W CIT1P00890 479 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W APL2P36000 726 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W BOI1P38041 980 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W ERP5P38819 212 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W RNR4P49723 345 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W HIF1Q12373 385 aa8.15□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W BAS1P22035 811 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W HIR1P32479 840 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W RXT2P38255 430 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W CDC6P09119 513 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W GCG1P32656 232 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W MRP8P35719 219 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W ALG5P40350 334 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W UBA2P52488 636 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W ZIP2P53061 704 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W MDM1Q01846 1127 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YKR005CQ02203 525 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W USA1Q03714 838 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W GIS4Q04233 774 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W KIP1P28742 1111 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YKR015CP36111 568 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YPL216WQ08964 1102 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W NFI1Q12216 726 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W SEC2P17065 759 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W TAF6P53040 516 aa8.14□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W ENO2P00925 437 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W GCN3P14741 305 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W APL6P46682 809 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W SLA2P33338 968 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YEL1P34225 687 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W JEM1P40358 645 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YNL320WP42840 284 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W COS5P47187 383 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W ADR1P07248 1323 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W TFC4P33339 1025 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W AXL1P40851 1208 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W RPA14P50106 137 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W HSP78P33416 811 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W FMP33P46998 180 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W SHR3Q02774 210 aa8.13□□□□□ -1.11
YRF1-5YLR467W YLR271WQ06152 274 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.2 ms