RNA–Protein interactions for RNA: YDR261C-D

YDR261C-D, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeast

Gene YDR261C-D, Length 4,815 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YDR261C-D	YDR261C-D	JEM1	P40358	645 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SPO22	P40511	975 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	KEL2	P50090	882 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SRL4	Q03085	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	PPN1	Q04119	674 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SRS2	P12954	1174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	OPI1	P21957	404 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TSR4	P25040	408 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RSC6	P25632	483 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	NGG1	P32494	702 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	CIN4	P39110	191 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	EPL1	P43572	832 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	UBP2	Q01476	1272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TBF1	Q02457	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RAD33	Q04231	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	BOP2	Q06150	570 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	LSO1	Q3E827	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TAF2	P23255	1407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TDA11	P38854	504 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RIC1	P40395	1056 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YGR237C	P50089	785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YGR021W	P53212	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	CDC123	Q05791	360 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YLR352W	Q06479	807 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RSA1	Q08932	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	NSL1	Q12143	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	PHO81	P17442	1178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	KAR9	P32526	644 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	MIA40	P36046	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	AIM2	P39721	246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YTA12	P40341	825 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YAP6	Q03935	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	DYN3	Q04949	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	AIM41	Q12032	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	EDE1	P34216	1381 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RGP1	P16664	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	CBF1	P17106	351 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SSH4	P32343	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	AIM29	P36154	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	IES2	P40154	320 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YNL193W	P53870	558 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	ATG20	Q07528	640 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YPL257W	Q08974	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SWI5	P08153	709 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	VMA22	P38784	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	CNN1	P43618	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	NMD5	P46970	1048 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	PEX15	Q08215	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TAF3	Q12297	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	KIN28	P06242	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RMD6	P39975	231 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RRN11	Q04712	507 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	OM45	P16547	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RRM3	P38766	723 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	IAH1	P41734	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TAF8	Q03750	510 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	MSH5	Q12175	901 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	OSW2	Q12202	724 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	KTR6	P54070	446 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SPO21	Q12411	609 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RAM1	P22007	431 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	NAM9	P27929	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	MGE1	P38523	228 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	RIM11	P38615	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	MTG2	P38860	518 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	YRB2	P40517	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	VPS20	Q04272	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SRO7	Q12038	1033 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	SEC66	P33754	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	LEM3	P42838	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YDR261C-D	YDR261C-D	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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