RNA–Protein interactions for RNA: YDR138W

HPR1, Transcript of Subunit of THO/TREX complexes, yeast

Gene HPR1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPR1	YDR138W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPR1	YDR138W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HPR1	YDR138W	MET7	Q08645	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HPR1	YDR138W	PTP2	P29461	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YAR028W	P39548	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GCV1	P48015	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	CIA1	Q05583	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GUD1	Q07729	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	DIT1	P21623	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	AEP2	P22136	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	DBF20	P32328	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	HOG1	P32485	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	NFU1	P32860	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	REC104	P33323	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	HOS4	P40480	1083 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	TAD1	P53065	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	OPT2	Q06593	877 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	EMC3	P36039	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	CUZ1	P53899	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	MNN4	P36044	1178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YKE2	P52553	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	SPO21	Q12411	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ADE8	P04161	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	BIT2	P38346	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ERR3	P42222	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	NPY1	P53164	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GUP2	Q08929	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	BCK2	P33306	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GIP2	P40036	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	HIS6	P40545	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YML131W	Q03102	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ENT2	Q05785	613 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	NFS1	P25374	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YCL002C	P25565	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	RPN12	P32496	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	PHM6	Q05637	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	MLC2	Q06580	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	RRI2	Q12348	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ATP12	P22135	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	DPB3	P27344	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	TED1	P40533	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	PRO1	P32264	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	UGA2	P38067	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	FAT1	P38225	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	QRI7	P43122	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	VPS53	P47061	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	BNA1	P47096	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	LYS5	P50113	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	GIC1	P38785	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	SFB2	P53953	876 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	SSP2	Q08646	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	ACM1	Q08981	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	SNF5	P18480	905 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	FPS1	P23900	669 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	YJL045W	P47052	634 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	MDM38	Q08179	573 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPR1	YDR138W	BI4	P03879	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	LEM3	P42838	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	GIS4	Q04233	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	RMP1	Q12530	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ACA1	P39970	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	YGR153W	P48238	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	GYP7	P48365	746 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	ENV11	P53246	860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	DAM1	P53267	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPR1	YDR138W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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