RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W GDH3P39708 457 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W LCD1Q04377 747 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W MDM38Q08179 573 aa5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PEP1P32319 1579 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W NPP1P25353 742 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W SAH1P39954 449 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W RRT14P40470 206 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YPR071WQ12346 211 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W RPO31P04051 1460 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W ACE2P21192 770 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W DOM34P33309 386 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W KAE1P36132 386 aa5.98□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.97□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W KOG1P38873 1557 aa5.97□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W PDR10P51533 1564 aa5.97□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W TSC11P40061 1430 aa5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W YRO2P38079 344 aa5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W GYP7P48365 746 aa5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PRD1YCL057W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-FP0CX63 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-CP25384 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-DR2Q03494 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY1B-DR1Q03855 1755 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-OR1Q12113 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-DR1Q12472 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-OR2Q12501 1770 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TOM70P07213 617 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W GIC1P38785 314 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W NPP2P39997 493 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TOK1P40310 691 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SRT1Q03175 343 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W UGO1Q03327 502 aa5.96□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W ERT1P38140 529 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YKE2P52553 114 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YGR130CP53278 816 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W NTG2Q08214 380 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W RSB1Q08417 382 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W MDM12Q92328 271 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W ULS1Q08562 1619 aa5.95□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W PTC7P38797 343 aa5.94□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SSY1Q03770 852 aa5.94□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SVS1Q12254 260 aa5.94□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W FUN30P31380 1131 aa5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W REC104P33323 182 aa5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W HFM1P51979 1187 aa5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W NSI1Q12457 570 aa5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W GTS1P40956 396 aa5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W ALG2P43636 503 aa5.93□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY3B-GQ99315 1547 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TRP3P00937 484 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W AIM26P32858 118 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SEC26P41810 973 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YJR142WP47173 342 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W TY2B-BQ12491 1770 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W CYC7P00045 113 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YER158CP40095 573 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W ORC3P54790 616 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SDH1Q00711 640 aa5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SPS1P08458 490 aa5.91□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W ADP1P25371 1049 aa5.91□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W PRS1P32895 427 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W PEX6P33760 1030 aa5.91□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W DNM1P54861 757 aa5.91□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W MDS3P53094 1487 aa5.91□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W MEF1P25039 761 aa5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W CDC48P25694 835 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YAP1801P38856 637 aa5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SFB2P53953 876 aa5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W XYL2Q07993 356 aa5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W YGR161W-CQ3E744 92 aa5.9□□□□□ -1.46
PRD1YCL057W SPC29P33419 253 aa5.9□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W RFC5P38251 354 aa5.9□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W GYP8P43570 497 aa5.9□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.9□□□□□ -1.47not detected
PRD1YCL057W MTC5Q03897 1148 aa5.9□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W ENV7Q12003 364 aa5.9□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W RAD53P22216 821 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W RPC82P32349 654 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W YKR073CP36153 106 aa5.89□□□□□ -1.47
PRD1YCL057W EMC3P36039 253 aa5.89□□□□□ -1.47
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