RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W MEF2P39677 819 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W MAD1P40957 749 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W GCN5Q03330 439 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YDR132CQ03900 495 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YLR358CO13565 187 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W APL1P27351 700 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W SLA2P33338 968 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YKL222CP35995 705 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W SPC42P36094 363 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W PBP1P53297 722 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W DOS2P54858 310 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data6.8□□□□□ -1.32not detected
YKR104WYKR104W SIZ1Q04195 904 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W CMP2P14747 604 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W ACE2P21192 770 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data6.79□□□□□ -1.32not detected
YKR104WYKR104W MOT2P34909 587 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W FLR1P38124 548 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YGL176CP46945 554 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W SPT20P50875 604 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W GDE1Q02979 1223 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W PIN2Q12057 282 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W GAL10P04397 699 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W DBP2P24783 546 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W NNF1P47149 201 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W CWC24P53769 259 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W BI4P03879 638 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data6.77□□□□□ -1.33not detected
YKR104WYKR104W GIP4P39732 760 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W FAA4P47912 694 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W ROT1Q03691 256 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W YPL066WQ12194 479 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W DOM34P33309 386 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W VPS16Q03308 798 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W HSL1P34244 1518 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W TAF1P46677 1066 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W MSC2Q03455 724 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W PLB2Q03674 706 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W DUS4Q06063 367 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W RXT3Q07458 294 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data6.75□□□□□ -1.33not detected
YKR104WYKR104W SRM1P21827 482 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W SBA1P28707 216 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W SIP5P40210 489 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W YLL058WQ12198 575 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W AGP1P25376 633 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W GPB1Q08886 897 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W HFM1P51979 1187 aa6.72□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
YKR104WYKR104W OSW2Q12202 724 aa6.71□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W TAT2P38967 592 aa6.7□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W RTS3P53289 263 aa6.7□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W CDC20P26309 610 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W NUG1P40010 520 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W MTC3P53077 123 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SHE9Q04172 456 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W ESC2Q06340 456 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W OPI10Q08202 246 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data6.68□□□□□ -1.34not detected
YKR104WYKR104W MDM38Q08179 573 aa6.68□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W YAP1801P38856 637 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SAH1P39954 449 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W MND2P40577 368 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W YJR008WP47085 338 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W VPS62P53285 467 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W HRQ1Q05549 1077 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W CDC6P09119 513 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W STE11P23561 717 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W CTS1P29029 562 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W FUN30P31380 1131 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W ZRG8P40021 1076 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W URN1Q06525 465 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SCT1P32784 759 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W MRP8P35719 219 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W YKL151CP36059 337 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SHM2P37291 469 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W POA1P38218 177 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SUB1P54000 292 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W SRT1Q03175 343 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W HMI1Q12039 706 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W YOL098CQ12496 1037 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR104WYKR104W ENA1P13587 1091 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR104WYKR104W EMC1P25574 760 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR104WYKR104W PPG1P32838 368 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR104WYKR104W RRP14P36080 434 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YKR104WYKR104W VBA5P36172 582 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.5 ms