RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC3	YJL059W	TMA108	P40462	946 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	GPG1	P53130	126 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	TLG1	Q03322	224 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	RCF1	Q03713	159 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	TAF8	Q03750	510 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	SHE9	Q04172	456 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	YPQ2	Q06328	317 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	GIC2	Q06648	383 aa		7.76	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	GCR1	P07261	785 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	CHS3	P29465	1165 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	NIC96	P34077	839 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	YKL133C	P36066	463 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	LDH1	P38139	375 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	RSC1	P53236	928 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	YPL109C	Q02981	657 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	REH1	Q06709	432 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	WTM2	Q12206	467 aa		7.75	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	STE6	P12866	1290 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	MSM1	P22438	575 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	BRF1	P29056	596 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	MET22	P32179	357 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	YKL050C	P35736	922 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	BAP2	P38084	609 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	APE4	P38821	490 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	RAD55	P38953	406 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	SAP185	P40856	1058 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	SUM1	P46676	1062 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	MLC2	Q06580	163 aa		7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	HOM3	P10869	527 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	ANP1	P32629	500 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	HSP78	P33416	811 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	PBY1	P38254	753 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	GDH3	P39708	457 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	FIR1	P40020	876 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	ERO1	Q03103	563 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	TCB1	Q12466	1186 aa		7.73	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	PXA2	P34230	853 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	VBA5	P36172	582 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	DYS1	P38791	387 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	NTA1	P40354	457 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	EEB1	Q02891	456 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	ADI1	Q03677	179 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	PHM6	Q05637	104 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	MRL1	Q06815	381 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	MED1	Q12321	566 aa		7.72	□□□□□ -1.17
YHC3	YJL059W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PPH3	P32345	308 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	DSS1	P39112	969 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	ESL1	P40456	1118 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	ALR2	P43553	858 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	CNN1	P43618	361 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PFD1	P46988	109 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	IML2	P47031	731 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	GPI8	P49018	411 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	YNR063W	P53749	607 aa		7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	AFT1	P22149	690 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	GSY1	P23337	708 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	DBF20	P32328	564 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	MCM10	P32354	571 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	BET3	P36149	193 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	YBR287W	P38355	427 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	CTF4	Q01454	927 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	YMR018W	Q04364	514 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	OPY2	Q06810	360 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	SSP2	Q08646	371 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	SPT7	P35177	1332 aa		7.7	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	FLP1	P03870	423 aa		7.69	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	IMP2'	P32351	346 aa		7.69	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PES4	P39684	611 aa		7.69	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	ULP1	Q02724	621 aa		7.69	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	KCC4	P25389	1037 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	NUP120	P35729	1037 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	CAJ1	P39101	391 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PSY2	P40164	858 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	RGD2	P43556	714 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	PKH1	Q03407	766 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	YDR444W	Q04093	687 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YHC3	YJL059W	YDR056C	Q12025	205 aa		7.68	□□□□□ -1.18

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