RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
SEC27	YGL137W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GNT1	Q12096	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SPP41	P38904	1435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	VTH1	P40438	1549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	VTH2	P40890	1549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	ARE1	P25628	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	MXR1	P40029	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	KIP1	P28742	1111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	THI4	P32318	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	UBP12	P39538	1254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GAS5	Q08193	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	EAR1	Q03212	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GAL11	P19659	1081 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GDH3	P39708	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	HNT2	P49775	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	NHA1	Q99271	985 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SAC7	P17121	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	NPP1	P25353	742 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YBR284W	P38150	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	GPB2	P39717	880 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SIT1	P39980	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YFL066C	P43538	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	TSR4	P25040	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	NPP2	P39997	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SLA2	P33338	968 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	CCC2	P38995	1004 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	MTC3	P53077	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	RRM3	P38766	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	TSC11	P40061	1430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	SNF5	P18480	905 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YJL045W	P47052	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	ALT1	P52893	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	MDM12	Q92328	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEC27	YGL137W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	GPT2	P36148	743 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	BAP2	P38084	609 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	HUL4	P40985	892 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	VPS53	P47061	822 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	DSE4	P53753	1117 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	BUD9	P53226	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SPO21	Q12411	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	PET10	P36139	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	GPG1	P53130	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	DPH6	Q12429	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	UGO1	Q03327	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	ATG13	Q06628	738 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	LAP2	Q10740	671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SNT2	P53127	1403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SAM35	P14693	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	ADR1	P07248	1323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	NFS1	P25374	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	UGA2	P38067	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	GYP8	P43570	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	SRM1	P21827	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEC27	YGL137W	NNK1	P36003	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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