RNA–Protein interactions for RNA: YAL016W

TPD3, Transcript of Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex, yeast

Gene TPD3, Length 1,908 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPD3	YAL016W	YAR028W	P39548	234 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	OPT2	Q06593	877 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	SFL1	P20134	766 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	FPS1	P23900	669 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	NFS1	P25374	497 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	MXR1	P40029	184 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	PEA2	P40091	420 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	TOK1	P40310	691 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	GYP8	P43570	497 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	YJR096W	P47137	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	GCV1	P48015	400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	LCD1	Q04377	747 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	LAP2	Q10740	671 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	NPP1	P25353	742 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	CUZ1	P53899	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	SPO21	Q12411	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPD3	YAL016W	ADE8	P04161	214 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	MTC2	P34246	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GPB2	P39717	880 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	IES5	P40060	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YGR021W	P53212	290 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YGR045C	P53229	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	KIP1	P28742	1111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	BOI2	P39969	1040 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GIP2	P40036	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	LEM3	P42838	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	VPS53	P47061	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	TED1	P40533	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	AIM14	P53109	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	RSC3	Q06639	885 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	NKP1	Q12493	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ERS1	P17261	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	REC104	P33323	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YEL1	P34225	687 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YKL151C	P36059	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	PIP2	P52960	996 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	UBX4	P54730	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	MET14	Q02196	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GUD1	Q07729	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	PER1	P25625	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	DAL3	P32459	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YKL222C	P35995	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	CKB2	P38930	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YFL054C	P43549	646 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	CAF16	P43569	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SCW11	P53189	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	MET7	Q08645	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GAL1	P04385	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	DPB3	P27344	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	HSP78	P33416	811 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	MCD4	P36051	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	HSE1	P38753	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ERP2	P39704	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ROG3	P43602	733 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SPC105	P53148	917 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ENV7	Q12003	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ELG1	Q12050	791 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	HMG1	P12683	1054 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	PRO1	P32264	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SCT1	P32784	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SLA2	P33338	968 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	NIT2	P47016	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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