RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif18aQ91WD7 886 aa27.49■■□□□ 1.99
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Col4a1P02463 1669 aa27.46■■□□□ 1.99
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Nphp1Q9QY53 687 aa27.43■■□□□ 1.98
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa27.43■■□□□ 1.98
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmc1Q8R4P5 757 aa27.4■■□□□ 1.98
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Ak7Q9D2H2 614 aa27.39■■□□□ 1.98
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cntnap1O54991 1385 aa27.39■■□□□ 1.98
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Opn3-201ENSMUST00000027809 MypnQ5DTJ9 1315 aa27.39■■□□□ 1.97
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Atg4aQ8C9S8 396 aa27.38■■□□□ 1.97
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Map3k13Q1HKZ5 959 aa27.37■■□□□ 1.97
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa27.36■■□□□ 1.97
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Ddx58Q6Q899 926 aa27.34■■□□□ 1.97
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa27.34■■□□□ 1.97
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Mrc1Q61830 1456 aa27.32■■□□□ 1.96
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ltbp1Q8CG19 1712 aa27.31■■□□□ 1.96
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Opn3-201ENSMUST00000027809 MetP16056 1379 aa27.3■■□□□ 1.96
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hoxa7P02830 229 aa27.29■■□□□ 1.96
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Abca3Q8R420 1704 aa27.28■■□□□ 1.96
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Sos2Q02384 1333 aa27.27■■□□□ 1.96
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa27.27■■□□□ 1.96
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ank1Q02357 1862 aa27.27■■□□□ 1.96
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fkbp5Q64378 456 aa27.26■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nlrp9bQ66X22 1003 aa27.26■■□□□ 1.95
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa27.25■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 VgfQ0VGU4 617 aa27.24■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 AbraQ8BUZ1 375 aa27.24■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 AK157302I3ITR1 129 aa27.24■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Clcn1Q64347 994 aa27.24■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Isca1Q9D924 129 aa27.24■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 InsrrQ9WTL4 1300 aa27.23■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Soga3Q6NZL0 945 aa27.23■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 NmiO35309 314 aa27.22■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ehd4Q9EQP2 541 aa27.22■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abcc4E9Q236 1325 aa27.22■■□□□ 1.95
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
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