RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	MRPS28	P21771	286 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CHA4	P43634	648 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	JJJ2	P46997	583 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ORC3	P54790	616 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TRS130	Q03660	1102 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SLP1	Q12232	587 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MRPS18	P42847	217 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TRS85	P46944	698 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AIM23	P47015	356 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SRB7	P47822	140 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MRS2	Q01926	470 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FIN1	Q03898	291 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	STB4	P50104	949 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GAL4	P04386	881 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YBP1	P38315	674 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RCY1	P39531	840 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PXA1	P41909	870 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EMP47	P43555	445 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	STE23	Q06010	1027 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VTA1	Q06263	330 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	VIK1	Q12045	647 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GYP5	Q12344	894 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RAD27	P26793	382 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PIM1	P36775	1133 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YBL036C	P38197	257 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	POL32	P47110	350 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	NTO1	Q12311	748 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SRN2	Q99176	213 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	EST2	Q06163	884 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SPO75	Q07798	868 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	NAM9	P27929	486 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RGA2	Q06407	1009 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	DIT2	P21595	489 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	IME2	P32581	645 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FAR3	P46671	204 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CTH1	P47976	325 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MRPL50	P53724	139 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SPP41	P38904	1435 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	NMT1	P14743	455 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ECM4	P36156	370 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CTM1	P38818	585 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YNL011C	P53980	444 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TAF10	Q12030	206 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PSF3	Q12146	194 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RAD4	P14736	754 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GCN3	P14741	305 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RPC82	P32349	654 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.93	□□□□□ -1.94	not detected
TOM1	YDR457W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YIL166C	P40445	542 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	FMS1	P50264	508 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ATG7	P38862	630 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MTW1	P39731	289 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	GYP8	P43570	497 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TBF1	Q02457	562 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YMR010W	Q03687	405 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CAB1	Q04430	367 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MRPL40	P36534	297 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	SPO22	P40511	975 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MDR1	P53258	950 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YNL260C	P53846	198 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	MLH2	Q07980	695 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AAD15	Q08361	143 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
TOM1	YDR457W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	HSP78	P33416	811 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	LHS1	P36016	881 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	UBP13	P38187	747 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	YIL001W	P40560	513 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	CTF18	P49956	741 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	TAF6	P53040	516 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	ZIP2	P53061	704 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TOM1	YDR457W	RCM1	P53972	490 aa		2.92	□□□□□ -1.94

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